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查阅计算模型怎样结合实验和患者资料，分析药物响应与风险。
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Science 综述讨论人源细胞、类器官、器官芯片与计算方法如何共同支持药物研发。文章梳理不同模型的取舍、实验与计算的迭代，以及作者提出的药物发现、系统安全、多供体响应和数字孪生 4 个推进方向。
日本研究团队建立可分别接触肠腔侧与基底侧的类器官衍生单层，并比较多供者、屏障、转运及代谢功能。模型对 19 种药物的通透性与人体吸收比例相关；纳入肠代谢校正后，9 种药物中 7 种的估计值落在人体参考值的 1.5 倍范围。
FDA 与 Instem 团队建立 5 个 CYP 抑制预测模型，分别评价可逆抑制与时间依赖性抑制。研究以已批准药物和其他化学物进行外部验证，并加入结构警示信息，讨论计算预测在药物相互作用评价中的用途。
FDA 作者将体外受体结合资料与临床药代数据加入数学模型，比较纳洛酮和 3 种纳美芬制剂。模拟将早期吸收与后期持续作用分开分析，并说明人群差异、混合用药和观测时间限制如何影响结果的解释。
Annual Review of Pharmacology and Toxicology 的一篇综述讨论 iPSC、组学和 AI 如何共同支持疾病机制、候选药物验证及群体尺度的药物响应研究，涵盖心血管模型、图像与功能分析，并指出细胞成熟度和训练数据偏差等限制。
European Heart Journal 的综述讨论患者来源 iPSC 在心血管药物研究中的用途，包括多供者心脏安全性比较、药物响应分层及个体化研究。文章结合心脏类器官、微生理系统、组学和计算分析，提出与临床研究配合的体外试验框架。
佐治亚理工学院与埃默里大学研究将中尺度灌流培养、明场成像和分类算法整合，持续观察单个脑类器官。样本筛选结合多个时间点的形态信息，后续再用组织及转录组分析比较筛选所得的模型。
斯坦福大学与合作团队在 2024 年发表 ADMET-AI，将多任务模型、获批药物参照和本地批量预测结合。研究说明了数据集评价、预测值展示和速度比较的具体范围，为计算 NAMs 的使用提供实例。
Nature Reviews Drug Discovery 的评论以 CiPA 为例，讨论人源模型预测药物作用时的多中心一致性、遗传差异和规模化问题。混合供者测量与计算方法各有适用信息，通量提高不应掩盖功能测量的损失。
CPCA 根据亚硝胺杂质的结构和既有致癌性资料预测致癌效力类别，再对应推荐可接受摄入限度。FDA 与其他药品监管机构开发这一方法，重点解决杂质缺少直接安全性数据、也难以找到合适参照物时的评价难题。
2024 年一项随机交叉试验测量健康志愿者的纳洛酮血药浓度，再使用生理药代—药效模型估计虚拟患者的反应。研究将真实浓度测量与计算结局分开，用于比较不同暴露时间曲线的意义。
2024 年 medRxiv 预印本提出串联细胞药物响应、患者治疗响应与总生存预测的计算框架，并以虚拟人群比较 8 项历史临床试验的结果方向。模型展示了临床数据与细胞筛选整合的用途。
Nature Immunology 的一项研究用脑组织成分诱导人源干细胞衍生小胶质细胞的不同状态，并与人脑单细胞数据比较。研究发现 DAM 样状态依赖 TREM2，MITF 可增强部分相关基因表达和吞噬功能，同时揭示体外模型与人脑状态仍有差异。
Science Translational Medicine 的研究建立 57 名患者来源的 65 个肝癌类器官，整合基因组、表观遗传、转录与蛋白信息，并筛选 76 种药物。研究区分增殖与代谢亚型，进一步在部分模型中检验仑伐替尼与替西罗莫司的组合。
2023 年发表于 Food and Chemical Toxicology 的综述梳理肝损伤计算预测。训练数据如何定义肝损伤、模型能否用于新的药物，以及结构、暴露和体外检测数据怎样结合，是影响预测结果的关键问题。
Cell Stem Cell 的研究以人源 iPSC 心肌细胞动作电位训练分类器，比较 37 种药物和 8 个细胞系。模型将波形转换为连续概率，再结合临床游离药物浓度形成安全性指标，同时观察心肌病相关遗传背景中的差异。
英国团队在结肠类器官中确定 IL-22 调控的转录特征，再与溃疡性结肠炎活检及 UNIFI 试验资料比较。研究发现，治疗前特征富集程度与乌司奴单抗响应有关，并通过上皮模型研究中性粒细胞趋化及 JAK/STAT 相关药物作用。
Cell Reports 研究用结肠类器官建立细胞因子响应特征，再与患者黏膜转录组和临床治疗结局比较。多条通路同时活跃比单一细胞因子分型更能解释部分患者差异，并提示共同转录调控节点。
2022 年一项研究结合药代、受体结合与呼吸循环生理，分别用独立体外、动物和人体资料检验模型。作者随后在虚拟人群中比较纳洛酮制剂，预测吸收速度与呼吸抑制逆转的关系，并说明药代资料、受体假设及验证范围的限制。
德国团队对 11 个患者来源结直肠癌类器官模型开展大规模图像表型分析，结合药物活性与组学数据解释大小、囊性结构及信号通路的联系。形态变化能够补充活力测量，部分变化并不伴随明显细胞死亡。
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