NAMs新方法学前沿

药物靶点方法

查阅药物靶点相关方法的细胞与材料、测量指标、验证条件和原始资料。

方法条目

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共 4 个方法 · 显示 1–4 个

药物靶点计算模型

MISATO 蛋白质–配体相对亲和力预测

用 MISATO(molecular interactions are structurally optimized)整理的复合物结构及动态、电荷特征,预测同一蛋白结合不同配体时的相对亲和力。

测量指标
同蛋白配体对的相对亲和力、各蛋白组的 Spearman 相关系数、加入动态和电荷特征后的基准变化
研究设计
药物集评价
药物靶点计算模型

SOAR 空间表达与药物扰动匹配的再利用候选筛选

将细胞类型差异表达和空间变化与既有 CMap/L1000 药物扰动匹配,筛选表达方向相反的候选。

测量指标
差异表达与空间变化、富集分数(enrichment score,ES)与多重检验校正显著性、候选排名、基因-药物扰动及蛋白相互作用网络
研究设计
实验条件比较
药物靶点计算模型

α-突触核蛋白抑制剂的结构迭代学习与生化验证

以分子潜在表示、随机森林及高斯过程对实测聚集效力建模,逐轮选择候选并加入新实验结果。

测量指标
相对聚集半程时间 t₁/₂、动力学指标 KIC₅₀、SPR 结合 Kd、寡聚体速率模型推断与电泳粒子比较
研究设计
实验条件比较
药物靶点靶点测定面板

SAFETYscan47 次级药理安全筛查

通过 47 种与人体安全性相关的靶蛋白的体外测定,回顾性寻找停止临床开发的小分子的安全机制线索。

测量指标
相对于参照对照的功能或结合反应、浓度—反应关系、主要靶点与其他靶点作用组合
研究设计
药物集评价

方法比较

按具体版本、测试药物与用途比较;不同研究的性能数字须结合各自条件阅读。— 表示当前条目未收录该信息。

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