
NET 与 NEC 的类器官建库背景
2020 年 11 月,Cell 发表神经内分泌肿瘤类器官库研究。日本庆应义塾大学(Keio University)与理化学研究所(RIKEN)等团队用了 5 年收集临床样本,建立 25 个模型,缓解这类罕见肿瘤研究材料不足的问题。
研究对象包括分化程度较高的神经内分泌肿瘤(neuroendocrine tumor,NET)和低分化神经内分泌癌(neuroendocrine carcinoma,NEC)。两类肿瘤具有不同的组织学特点和进展方式。
患者数量少、可持续研究的细胞材料有限,使分子分析和候选药物比较都面临困难。此次研究将患者肿瘤保存在可扩增的三维模型中,再结合组学、功能测量与药物反应分析,形成研究罕见肿瘤的共享资源。
25 个模型的来源和组成
类器官库包含 18 个消化系统 NEC 模型、3 个来自胰腺和十二指肠的 NET 模型,以及 4 个肺小细胞癌模型。消化系统样本涉及食管、胃、十二指肠、胰腺、肝脏和胆管等部位。
纳入肺小细胞癌,为比较不同组织来源的神经内分泌肿瘤提供了参照。库内同时保留 NET 与 NEC,也使研究能够考察分化状态、功能表现和恶性生物学行为之间的差别。
比较遗传特征、形态和内分泌功能
团队对类器官开展包括基因组、RNA、蛋白质和代谢物在内的多组学分析,并结合小鼠移植结果与原始肿瘤比较。机构报道指出,这些模型保留了原肿瘤的基因型与形态等表型。
NET 模型来自胰腺及十二指肠。其中的胃泌素瘤模型在小鼠移植后,保留了原肿瘤的胃泌素分泌功能;机构报道也展示了模型与患者的药物反应比较。
TP53、RB1 异常与转录程序改变
全基因组分析发现,消化系统 NEC 中 TP53 和 RB1 的异常较常见,与肺小细胞癌具有相似之处。论文摘要还报告了染色体范围的杂合性缺失。
转录组分析识别出具有不同转录因子表达的分子亚型。正常消化组织相关的表达程序减弱,部分模型出现通常与神经或心脏发育相关的 ASCL1、NKX2-5 等转录因子表达。机构报道将这类表达程序变化与表观遗传调控联系起来。
功能研究发现,TP53 与 RB1 的异常本身不足以让正常结肠模型呈现完整的 NEC 特征;转录程序变化也参与了这一过程。团队进一步在正常来源模型中重现了相关的神经内分泌肿瘤表型,把患者材料中发现的分子异常与细胞性状联系起来。
生长依赖性与顺铂响应提供药物研究线索
这些神经内分泌肿瘤模型还表现出对外部生长信号的不同依赖。研究发现,部分模型在缺少正常细胞所需的生长刺激时仍能增殖,而这种独立性并不总伴随相应生长信号通路的典型基因突变。
研究进一步发现,与转录程序改变相关的 6 个关键因子的表达,可使模型获得不依赖这些外部生长信号的增殖能力。
机构报道指出,消化系统 NEC 类器官对顺铂表现出敏感性,与该药在此类肿瘤中的临床用途相符。
同一患者不同病变的演变关系
研究还比较了同一患者中普通结肠肿瘤与 NEC 来源的模型。它们共享的遗传特征,以及 NEC 中增加的 TP53、RB1 异常,为普通结肠肿瘤向 NEC 演变的关系提供了线索。
此次工作形成的资源,使罕见肿瘤的分子亚型、细胞功能和药物响应可以在同一批人源模型中研究。它为扩大候选药物比较、解释个体差异以及检验分子机制提供了可持续使用的实验基础。
来源与延伸阅读
- Kawasaki K, Toshimitsu K, Matano M, et al. An Organoid Biobank of Neuroendocrine Neoplasms Enables Genotype-Phenotype Mapping. Cell. 2020;183(5):1420–1435.e21. doi:10.1016/j.cell.2020.10.023. ↗
- 慶應義塾大学医学部・理化学研究所. ヒト肝胆膵・消化管神経内分泌がんを大量培養しライブラリー化 希少がん研究に突破口-がん化を決定づける因子が明らかに-. 2020年11月18日. ↗