从芯片浓度变化估计人体清除

肝细胞实验能记录药物随时间减少,但把这一变化换算到人体,还需要考虑细胞内外分布、游离比例和培养装置的影响。2025 年发表于 PLOS ONE 的 DigiLoCS 研究,将这些因素纳入三区室计算模型,再与人体药代模型连接。研究重新分析已有数据,本次没有开展新的细胞实验。

数据来自 5 项已发表研究,覆盖 CnBio 和 Javelin 肝芯片,以及 Hurel 肝细胞球状体系统。原始集合共有 38 项药物清除数据,因部分记录缺少必要输入,最终纳入 32 项。不同系统的细胞数、培养液体积和流动方式分别作为模型参数。

把培养液、细胞间隙和细胞内部单独建模

DigiLoCS 将系统划分为培养液、细胞间隙和细胞内部三个区室,用常微分方程描述药物转移与代谢。模型纳入膜通透性、分配特征、游离药物比例和细胞内清除,使培养液中的浓度变化能与细胞内暴露联系起来。

输入既包括细胞数、体积、表面积和灌流方式,也包括分子量、脂溶性及培养液中的游离比例。研究根据已发表浓度时间曲线拟合清除等参数,并检查参数变化对结果的影响。敏感性分析显示,通透性、交换表面积和游离比例会影响清除估计。

清除预测更接近已有临床数据

研究将芯片模型估计的细胞清除换算到人体,与已有临床清除数据比较。以图 6 的“预测值/观察值”为比值,DigiLoCS 的分布中心约为 1.04,标准差约为 0.31,变异系数约为 30%;单区室方法约为 0.56,标准差约为 0.44,变异系数约为 79.3%。

在这组数据中,单区室方法整体倾向于低估清除,DigiLoCS 的比值更集中在 1 附近。论文还单独展示了 CnBio 系统的 12 项数据,多数预测落在观察值的 1.5 倍范围内。这个子集与全部 32 项数据分别分析,便于检查不同系统的表现。

DigiLoCS 与单区室方法的人体药物清除预测比较;横轴为预测清除值与临床观察值之比。

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DigiLoCS 与单区室方法的人体药物清除预测比较;横轴为预测清除值与临床观察值之比。(Manoja Rajalakshmi Aravindakshan et al. / PLOS ONE, 2025, Fig. 6;CC BY 4.0)

用普萘洛尔检查对浓度曲线的影响

研究以普萘洛尔为例,在 PK-Sim 中建立生理药代动力学模型(physiologically based pharmacokinetic modelling,PBPK),先用已有临床观测核对模型,再分别换入两种体外分析得到的清除估计。模拟采用单次口服 80 mg 的既有研究情景,并生成 1000 个虚拟个体,描述个体间差异。

采用单区室清除估计时,模拟峰浓度约高估 3 倍,曲线下面积最高约高估 6 倍。换入 DigiLoCS 估计后,两者仍有约 1.5 倍的高估,但曲线终末阶段更接近已有观测。这个案例显示,体外清除估计会明显影响后续浓度时程模拟。

输入资料和比较数据决定预测范围

该工具为不同肝细胞培养系统提供了共同的计算分析方式,可用于比较材料、培养设置和药物性质对清除估计的影响。关键输入仍需要具体系统和化合物的资料,尤其是游离比例、细胞内分布以及可拟合的浓度时间数据。

本次表现来自回顾性数据分析,普萘洛尔只是其中一个人体浓度曲线案例。其他化合物、代谢途径和培养系统的适用程度,还需要相应数据支持。

来源与延伸阅读

  1. DigiLoCS: A leap forward in predictive organ-on-chip simulations PLOS ONE. 2025. doi:10.1371/journal.pone.0314083 ↗