类器官与间质细胞共同用于载荷筛选
胰腺导管腺癌的药物反应受肿瘤细胞、纤维化间质及其相互作用影响。卫材（Eisai）与 KAN Research Institute 团队在 Nature Communications 将类器官药筛与肿瘤—间质细胞共培养结合，寻找既能抑制癌细胞、又能改变间质信号的抗体偶联药物（antibody–drug conjugate，ADC）载荷。
团队先选用两种患者来源异种移植模型（patient-derived xenograft，PDX）的肿瘤材料。胰腺癌 PC-3 属于经典型、MYC 信号较低，对吉西他滨较敏感；PC-42 属于基底样、MYC 信号较高，对吉西他滨耐受。由这些材料直接建立的类器官同时包含癌细胞和间质细胞，保留了相应的分化与药物反应特点。
在这两种类器官中筛选载荷时，常用的美登素和单甲基澳瑞他汀 E（monomethyl auristatin E，MMAE）对 PC-42 无效，BET（bromodomain and extra-terminal）蛋白家族的降解剂 EBET-1055 则在 2 种模型中均显示较强作用。进一步的共培养筛选观察多条间质信号，EBET-1055 可以抑制癌细胞诱发的间质信号升高，团队据此继续优化载荷。
在 16 个类器官中比较 ADC 载荷
研究采用 CEACAM6 为 ADC 靶点，将优化后的 EBET-1593 偶联到抗体 #84.7，形成 84-EBET，药物—抗体比为 4。团队在 16 个胰腺癌 PDX 衍生类器官中比较 84-EBET，以及同一抗体携带 MMAE 或德曲妥康（deruxtecan，DXd）载荷的版本。
多数模型中，84-EBET 产生较强细胞杀伤，另外两种载荷的作用受模型影响更大。CEACAM6 表达较低的基底样模型通常较耐受，不过 KYK-048 在这一组中仍高度敏感。研究因此同时保留了总体趋势和个别模型的不同反应。
类器官生长抑制试验在 384 孔低黏附板进行，肿瘤碎片嵌入含 10% 低生长因子 Matrigel 的培养液，给药后培养 5 天，再用 CellTiter-Glo 3D 测量活力。不同模型使用相应培养液，图中的每种反应设置 4 个生物重复并拟合浓度—反应曲线。
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区分靶细胞杀伤与邻近细胞效应
团队将 CEACAM6 阳性靶细胞与 CEACAM6 敲除细胞按不同比例共培养，用两种荧光素酶信号分别估计两类细胞的活力。只有在靶细胞存在时，ADC 才能使旁观者细胞的信号降低；84-EBET 的旁观者效应强于另外两种载荷版本。
与癌细胞共培养的间质细胞还接受了分泌测试。84-EBET 减少小鼠来源肿瘤相关成纤维细胞（cancer-associated fibroblast，CAF）的 IL-6 和 LIF 分泌，在这些测试浓度下并未降低 CAF 活力。结果支持载荷可改变邻近间质细胞功能，而相关变化不完全由细胞减少解释。
实验进一步加入人外周血单个核细胞，与癌细胞和 CAF 共同培养。CAF 抑制了免疫细胞对肿瘤的杀伤，并降低 IL-2 和 IFN-γ；84-EBET 处理后，肿瘤杀伤增强。该体系中的 CAF 为小鼠来源，免疫细胞为人源，研究分别测量细胞活力及相应物种的分泌指标。
把体外筛选与后续药物开发衔接
论文还报告了 PDX 及小鼠同系肿瘤中的药效，并测试与标准化疗或 PD-1 抗体联用。在 PC-42 模型中，化疗组合产生更深、维持更久的肿瘤退缩；同系模型中的 ADC 加 PD-1 抗体组，全部肿瘤退缩维持至少 3 个月。这些是后续动物研究的结果。
作者在体内间质分析中观察到炎症型 CAF 相关信号降低，而肌成纤维细胞型 CAF 的部分标志物变化不一致。研究将体外共培养与这些观察结合，讨论 BET 降解载荷对间质和免疫环境的作用。不同模型及指标提供了相互补充的资料。
后续载荷优化还使用人肺上皮、造血祖细胞和髓系细胞进行耐受性相关筛选。论文发表时，最终候选 ADC 正在推进用于猴耐受性测试的工艺开发。类器官和共培养在这项工作中承担的是筛选与机制评价环节，候选药物的后续非临床开发按各体系的结果继续推进。