37 个长期培养模型覆盖不同卵巢癌类型
法国 Université de Caen Normandie 与 Centre François Baclesse 等机构在 Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 报道了一组卵巢癌患者来源类器官。研究把同一模型的药物反应、基因组不稳定性和 DNA 修复功能放在一起比较,再对应患者含铂治疗后的结局。
团队从 31 名患者建立 37 个长期培养模型,包括 23 名高级别浆液性癌患者,以及透明细胞癌、癌肉瘤、子宫内膜样癌和黏液性癌患者。26 个模型来自实体肿瘤,11 个来自腹水;8 个模型的取材发生在既往治疗之后。
研究把连续扩增超过 8 代、冻存后能够恢复生长作为长期建模的标准,报告成功率为 13.8%。这一定义使模型适合反复扩增和比较实验,同时拉长了取材到药敏结果之间的时间。作者因此建议,临床应用研究应进一步评估早代模型和更快的测试流程。
15 对模型与原肿瘤接受基因组和转录组比较。拷贝数变化的相似程度为 0.4–1;表达谱也总体相关,但整体聚类仍将肿瘤和类器官分开。作者将这种差别部分归于类器官缺少基质细胞,并进一步用转录组分解方法比较肿瘤细胞相关特征。
改用 384 孔板后,药物反应与 96 孔结果总体一致
药筛使用直径 75–150 µm 的类器官。96 孔体系每孔接种 200 个,384 孔体系则减少到 50 个,接种 30 分钟后给药,1 周后用 CellTiter-Glo 3D 测 ATP 活力。测试培养液去除了 Primocin、Y-27632 和 N-乙酰半胱氨酸。
团队在 15 个模型中比较两种孔板的结果,药物反应的 Spearman 相关系数为 0.83。随后对 29 个模型测试卡铂、紫杉醇、多柔比星、吉西他滨、奥拉帕利和尼拉帕利,按浓度—反应曲线下面积比较敏感程度。
同一患者不同取材部位的模型,对大多数药物反应相近,但多柔比星出现了差别。4 个复发患者腹水模型也有不同反应,多数处于中等敏感至耐药范围。OV-301_T 对多种药物敏感,却对两种聚(ADP-核糖)聚合酶(poly(ADP-ribose) polymerase,PARP)抑制剂耐药;OV-130_A 的整体反应则较弱,但对奥拉帕利仍有反应。

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比较 9 个模型的卡铂药敏与患者无铂间期
临床对应分析先选择尚未接受化疗的高级别浆液性癌模型,最终纳入 9 个。卡铂 IC50 为 5.43–51.64 µM。研究将曲线下面积标准化后,以 0 为界划分相对敏感与耐药模型,再比较患者最后 1 周期卡铂治疗到复发之间的无铂间期。
5 个耐药模型对应患者的中位无铂间期为 1.61 个月,4 个敏感模型对应 6.80 个月,组间比较 p = 0.06。按患者无铂间期是否达到 6 个月分组,模型卡铂反应的差异同样未达到统计显著,p = 0.38。
OV-135_T 和 OV-301_T 对卡铂较敏感,但对应患者较早复发。2 名患者在最初化疗周期有明显反应,之后分别出现纵隔和主动脉旁淋巴结复发;OV-135 的腹水模型也表现为卡铂敏感。这些病例提示,体外短期药物反应与患者的后续复发过程涉及不同层面的信息。
照射后 RAD51 变化提供另一种修复功能检测
为研究同源重组修复功能,团队引入 RECAP 检测。类器官接受 5 Gy X 射线后,在不同时间固定、切片并染色。分析只统计 Cyclin A2 阳性细胞核中的 RAD51 焦点,利用未照射、照射后 2 小时和 24 小时的变化建立指标,再通过主成分分析分类。
这项分类与基因组不稳定性评分 GIScar 的分组存在统计关联,p = 0.04;但两种分组均未对应模型对卡铂、奥拉帕利或尼拉帕利的药物反应。奥拉帕利与卡铂药敏之间的相关性也未达到统计显著,而尼拉帕利与卡铂的相关性达到统计显著。
排除复发时取材的 2 个模型后,RECAP 分类中的修复缺陷组与修复功能完整组,中位无铂间期分别为 16.79 和 4.40 个月,p = 0.07。在 GIScar 判为修复功能完整的 15 个模型中,RECAP 将 3 个重新分入缺陷组;其中 2 名患者无铂间期超过 12 个月。
该队列接受 PARP 抑制剂的患者很少,研究没有建立检测结果与患者实际 PARP 抑制剂疗效之间的对应。作者把扩大样本、缩短测试时间,以及比较早代与长期模型列为后续重点。