
单细胞追踪发现两个不同的 p53 阶段
哈佛医学院(Harvard Medical School)与诺华生物医学研究所(Novartis Institutes for Biomedical Research)研究者在 2016 年发表于 Science 的论文中,研究降低 MDMX 后,癌细胞对 DNA 损伤的反应为何会随时间改变。团队使用单细胞活体成像,连续观察 p53 信号,再比较不同阶段受到第二次干预后的细胞命运。
研究采用小干扰 RNA(small interfering RNA,siRNA)降低 MDMX,模拟对该靶点的干预。在 MCF7 乳腺癌细胞中,MDMX 降低后,p53 先出现一次较高脉冲,随后进入持续的低幅振荡阶段。
不同细胞并不在同一时刻分裂,因此高脉冲也不同步。若只看整个细胞群的蛋白平均值,容易把许多错开的短脉冲误读为持续升高。随后出现的低幅振荡可持续至实验观察结束,最长跟踪约 60 小时;类似的双阶段动态在非癌性的 RPE1 细胞中也被观察到。
相近的 p53 振荡,不一定来自相同刺激
降低 MDMX 后的 p53 振荡,与 DNA 双链断裂引起的振荡有相似周期,但振幅较低。研究者未发现相应 DNA 损伤标志及主要损伤应答激酶的变化,因此认为该振荡不能简单归因于细胞已发生 DNA 损伤。
在第二阶段,细胞周期调控蛋白 p21 持续积累。其编码基因 CDKN1A 的转录量在 24 小时约升至原来的 8 倍,48 和 72 小时仍超过 5 倍,细胞也出现周期停滞。恢复 MDMX、压低 p53 振荡后,p21 减少,细胞更容易退出停滞状态。这些比较把动态信号与后续细胞状态联系起来。
第二次干预的时机可以改变相互作用方向
研究者分别在 MDMX 降低后的早期与晚期施加 DNA 损伤。较早的 12 小时条件下,细胞死亡比例由单独 DNA 损伤的 66% 增至 95%;较晚的 48 小时条件下,死亡比例则由 67% 降至 16%。上述数值来自紫外线损伤实验。
论文还报告,在多柔比星等 4 种化疗相关处理条件中,也观察到类似的时序依赖现象。这说明,第一次干预改变的细胞状态,可能使后续处理从增强杀伤转为减弱杀伤。
晚期两组在 DNA 损伤后的 p53 积累幅度相近,因此死亡减少不能仅由“p53 更少”解释。除了 p21 相关停滞,研究还观察到促存活信号磷酸化 Akt 增强、促凋亡蛋白 PUMA 积累减弱。作者认为,这些变化可能共同提高细胞对后续损伤的耐受性。
评价组合处理,需要同时观察信号与细胞命运
这项研究把连续成像、基因表达、细胞周期与存活观察放在同一框架内,显示一次终点检测可能遗漏重要的时间信息。同一靶点干预与同一损伤处理,在细胞处于不同状态时,可出现方向相反的相互作用。
作者由此提出,组合方案研究不仅需要比较剂量,还要理解每次干预如何改变细胞状态及其持续时间。本文提供的是培养细胞中的时序机制与比较方法,MDMX 候选抑制剂的具体效果仍需单独检验。