
20 个肺内病灶类器官中,16 个拷贝数正常
荷兰癌症研究所(Netherlands Cancer Institute)等团队在 Cell Reports 报道 70 余份非小细胞肺癌样本的培养经验。研究面向个体化药物模型:从肿瘤标本长出的三维培养物,是否仍由肿瘤细胞组成。
在拷贝数比较中,5 个正常气道类器官均呈正常特征,5 个肺外病灶来源肿瘤类器官均有多处增益或缺失;20 个肺内病灶类器官却有 16 个拷贝数正常,占 80%。这组遗传分析针对已经建立的类器官。
原肿瘤变异有助于确认培养物身份
正常拷贝数本身不能排除肿瘤,因为部分原发肺癌也缺少明显拷贝数异常。作者进一步核查原肿瘤已有的变异;部分培养物未检出这些变异,结合正常气道参照,支持正常细胞过度生长的解释。
研究主要用单核苷酸多态性阵列分析拷贝数,部分模型另用全基因组测序,并以原肿瘤变异为身份参照。作者提出,对拷贝数接近正常的肿瘤,可用基因测序补充判断。
p63 的空间分布帮助区分正常与肿瘤
囊性或实性外观都可能出现在正常及肿瘤类器官中,形态单独不足。正常气道类器官的 p63 常呈外层细胞阳性、腔内细胞阴性的极性分布;经遗传或来源确认的肿瘤类器官则丧失这一模式,呈阴性或杂乱分布。
正常气道类器官的甲状腺转录因子 1(thyroid transcription factor 1,TTF-1)也可强阳性,因此单看这一标志不能确认肿瘤身份。细胞角蛋白 5/6(cytokeratin 5/6,CK5/6)可提供补充线索,但某些基底样鳞癌同样表达,仍需结合形态和遗传证据。
纯度核查改变了 58 份标本的建模结果
在建立率分析中,58 份肿瘤标本有 24 份形成类器官培养物,占 41%;其中 14 份被认为是正常气道类器官。考虑这一因素后,作者报告纯肿瘤类器官建立率为 17%。
培养早期也可能同时含有正常和肿瘤类器官,正常细胞随后扩增并占据培养物。作者因此建议在药物研究中持续核查肿瘤纯度;形态与 p63 组合形成的分类思路,还需独立队列验证。