10 个患者模型保留肿瘤内的部分异质性
发表于 Neuro-Oncology Advances 的研究纳入 32 位胶质母细胞瘤患者，最终从其中 10 位患者的肿瘤样本建立可长期培养的类器官。模型包括 6 位 MGMT 启动子甲基化患者和 4 位未甲基化患者。团队比较了类器官与原肿瘤的基因变异和细胞状态：部分驱动基因改变得以保留，单细胞分析也显示同一模型内存在不同亚群。
这项模型表征关系到药物评价。研究用全外显子测序、单细胞核型和多重免疫染色分别检查遗传变异、亚群和组织内分布；各检测使用的模型子集不同，提供了几种互补的异质性读数。
替莫唑胺反应与 MGMT 状态有关，但模型间仍有差别
研究者用替莫唑胺处理类器官，并比较不同浓度下的细胞活力。未甲基化组在较低浓度时普遍耐受；甲基化组整体反应较强，但组内仍有两个模型未出现明显活力下降。以 30 微摩尔浓度比较时，未甲基化组仅一个模型出现显著下降。体外药敏与 MGMT 状态有关系，却没有把同组患者分成完全一致的反应。
团队还测试了化放疗条件和 EGFR 抑制剂奥希替尼。化放疗后多数类器官的敏感性较低，作者将其与患者一线治疗后进展的记录作了对应；奥希替尼剂量反应则在不同模型之间明显不同。奥希替尼实验展示了类器官测试靶向药反应的用途，文中没有报告这些患者使用奥希替尼的治疗结局。
处理后转录组指向 JNK，组合测试进入下一步
研究者比较替莫唑胺处理前后的类器官转录组，将 JNK 通路列为处理后上调的候选信号。随后在 5 个患者模型中测试 JNK 抑制剂 SP600125 与替莫唑胺：其中 4 个模型的组合处理比单药更有效。这一步把转录组线索接到了实测药物反应上。
后续浓度组合分析汇总了 3 个模型的数据，部分剂量组合的 Bliss 协同评分超过研究设定的阈值，不同类器官的最佳浓度组合也有差异。5 个模型的初步组合效果与 3 个模型的剂量协同计算分母不同，结果仍属于体外药物评价。作者提出可用这一模型继续寻找与耐药有关的干预途径。