
38 例未经治疗的胃癌组织进入分型研究
加拿大阿尔伯塔大学团队在单中心前瞻性收集了 38 例胃腺癌患者的组织。取材时间为 2019 年 6 月至 2022 年 1 月,患者此前未接受治疗,分期覆盖 I–IV 期。研究希望用较少的 RNA,比较原肿瘤与患者来源类器官(PDO)的分子状态。
在 16 份用于类器官建立的材料中,12 份培养成功,建立率为 75%;另有 2 份未生长、2 份发生真菌污染。病理复核发现其中 1 名患者的原取材组织未含癌,该培养物参加 EB 病毒和微卫星不稳定性参照检测,但不进入肿瘤药敏实验。
107 基因检测同时评价癌细胞状态和微环境信号
检测面板包含 57 个癌症基因组图谱(TCGA)分型相关基因及 50 个肿瘤微环境(TME)相关基因。研究以每份 100 ng RNA 进行 Nanostring nCounter 检测,经过质量控制、批次校正及表达分布转换,再输入既有分型模型。
TCGA 将胃癌分为 EB 病毒相关、微卫星不稳定、基因组稳定及染色体不稳定 4 类。38 例原肿瘤中,各类分别占 5.3%、15.8%、7.9% 和 71.1%。TME 高信号组占 13.2%,低于用于比较的公共队列。
研究以 EB 病毒编码小 RNA 原位杂交和微卫星聚合酶链式反应(PCR)作为 2 类状态的参照。在 10 对原组织与类器官中,面板对这两类状态的判断与参照完全一致。基因组稳定和染色体不稳定分型未在本研究中接受同样的基因组参照验证。
类器官培养后出现分型变化
在 11 个确认含癌的配对模型中,类器官与原肿瘤的 TCGA 分型一致率为 63.6%,TME 分型一致率为 81.8%。部分连续评分也随培养发生变化;微卫星不稳定性评分在未校正的配对检验中有统计差异。
例如,患者 55 的原组织属于 EB 病毒相关、TME 高信号组,类器官则转为染色体不稳定、TME 低信号组。作者将这类差别与肿瘤异质性、取材及培养选择等因素联系起来。
分型评分与短期化疗反应的关联未达显著
研究对 11 个确认含癌的类器官开展 FLOT 体外药敏,图 5 展示了 10 个模型的剂量曲线及相关分析。FLOT 包含氟尿嘧啶、亚叶酸、奥沙利铂和多西他赛;模型形成 24 小时后接受 48 小时处理,再用 CCK-8 检测细胞代谢活性。
模型间的药物反应不同,但药敏评分与所测分型评分之间的关联均未达到显著。作者又在 37 个公共胃癌细胞系中探索分型与药物反应,48 项初步关联经多重检验校正后均未保持显著。
这项研究支持用固定基因面板检查胃癌组织和培养模型的分型变化。其临床转化仍受单中心、小规模配对材料及随访限制,研究尚未比较分型指导治疗与常规治疗的患者结局。