台式离心机。
台式离心机。(Karbohut / Wikimedia Commons;CC BY-SA 4.0)

将细胞模型与千余名患者的临床数据联系起来

约翰斯·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)等团队在 Nature Neuroscience 介绍 Answer ALS 资源。项目结合超过 1,000 名肌萎缩侧索硬化(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)患者的纵向临床和手机数据,以及患者来源诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)细胞系与神经元多组学资料。

手机系统记录精细运动、语音、呼吸,以及语言与认知表现等信息。脊髓神经元来自由患者血液细胞建立的 iPSC,并接受全基因组、转录组、染色质可及性及蛋白质组分析。

开放数据用于分析 ALS 的患者差异

项目建立网页门户共享数据,供研究者结合生物信息学、统计和计算生物学分析临床与生物特征。作者希望据此识别患者亚组,并进一步理解不同 ALS 类型的疾病机制。

来源与延伸阅读

  1. Answer ALS, a large-scale resource for sporadic and familial ALS combining clinical and multi-omics data from induced pluripotent cell lines. Nature Neuroscience (2022). ↗