镜像取材让组织和类器官配对
前列腺癌同一器官内可出现多个病灶。瑞士伯尔尼大学(University of Bern)团队从 24 位患者的不同肿瘤灶和良性区域取得配对组织,一部分用于转录组分析,另一部分建立患者来源类器官。研究使用镜像取材的设计,减少组织表达谱与药物实验来自不同位置时的对应误差。
组织表达数据经主成分和聚类分析形成两个分组。模型中的分组主要反映组织样本层级,患者内不同病灶仍需单独辨认。作者进一步将这些分组与类器官药物反应比较,寻找能够说明差异的通路活动。

11 种药物中的几类反应与分组相关
类器官接受 11 种选定化合物处理,包括恩扎卢胺、几种酪氨酸激酶抑制剂、蒽环类和 mTOR 抑制剂,约 48 小时后测三维活力。克唑替尼、普纳替尼和舒尼替尼在该组模型中整体作用较明显;恩扎卢胺和部分 mTOR 抑制剂在此培养条件下活力抑制较弱。
两组组织分层在克唑替尼、普纳替尼、柔红霉素及舒尼替尼的读数上有差异。作者指出部分测试浓度高于人体可达到的最大血药浓度,且培养基中的雄激素成分可能影响恩扎卢胺的短时读数。药效排序应按这套体外暴露条件解读,距患者用药排序仍有临床暴露和疗效验证缺口。
计算分层仍需与功能药测共同理解
研究还用组织样本的通路活动建立计算分类模型,在 45 份训练样本中交叉验证,再对 16 份留出样本测试。这个分析预测的是研究定义的两个转录组分层,不是对每位患者临床药物获益的直接预测。
这篇研究的独立价值,是同一取样位置上的组织表达谱和类器官功能读数能够相互校验。模型内的组间差异有助于确定后续药物研究问题,但高于临床暴露的剂量及短期培养条件意味着仍需外部模型和临床材料核查。