模型分型先于药物比较

韩国延世大学(Yonsei University)团队尝试用 23 份肝内胆管癌样本建立类器官,成功建立并表征了 16 位患者对应的 16 个模型。其中 5 位患者的样本来自手术切除,11 位来自活检;后续分型和药测分别选取相应模型。病理学上,这类肿瘤可分为大胆管型与小胆管型;研究结合转录组、基因改变及组织形态,观察两类模型是否呈现不同分子特征。

转录组分型分析使用 13 个模型,其中大胆管型 8 个、小胆管型 5 个;药测则从两组各选 3 个模型,共 6 个。基因特征为选择药物比较提供背景,但并不直接等于药物敏感性。

肝内胆管癌大胆管型与小胆管型类器官各三模型药敏比较概念图
原创示意:大胆管与小胆管型类器官分别取 3 个模型,比较同一联合化疗的体外反应。(图:J&E Bio)

吉西他滨与顺铂用药后,两种病理类型反应不同

研究随后从两种病理类型各选 3 个类器官模型,共 6 个生物学独立模型,测试吉西他滨与顺铂合用后的剂量反应。模型先在孔板培养,再在药物处理 3 天后测活力并计算半数抑制浓度。

大胆管型组的联合用药半数抑制浓度整体高于小胆管型组,原文报告组间差异 P = 0.002。这个结果来自 3 对 3 的小样本比较。胆管类型与药物反应可能有关,但尚不足以单凭病理标签判断个体患者的疗效。

患者病程提供两个方向相符的个例

论文列出 YCO-5 与 YCO-15 的体外读数和治疗资料。YCO-5 模型对吉西他滨/顺铂的半数抑制浓度约 1.73 μmol/L,患者报告的无进展生存期为 434 天;YCO-15 的相应浓度约 11.16 μmol/L,患者无进展生存期为 161 天。2 例方向与模型药敏相符。

个例对照帮助说明人源类器官与真实病程可以怎样配合分析;这 2 例尚不足以估算临床预测准确率。本文更稳固的贡献是同一套模型中分别完成病理/组学分型和小规模药物比较,显示分类与功能读数可以相互补充。

来源与延伸阅读

  1. Integrative analysis of multiple genomic data from intrahepatic cholangiocarcinoma organoids enables tumor subtyping. Nature Communications. First online 2023-01-16. ↗