
把已有计算候选带回人源三维模型
加州大学旧金山分校(University of California, San Francisco)等机构的团队此前通过表达特征逆转分析提出子宫内膜异位症候选药物,并开展动物研究。9 月 27 日的新预印本进一步用人源上皮与基质细胞的组装体,检查候选对基因表达的影响。
这次人源三维实验的主要终点是药物处理后的转录反应,尚未评价患者疼痛变化。
细胞系模型与患者在位内膜模型分别比较
研究使用永生化的 12Z 上皮和 iEc 基质细胞系,也使用 2 位子宫内膜异位症患者的在位子宫内膜材料建立组装体。在位内膜来自子宫腔内,与异位病灶取材不同。
细胞系组装体形成上皮在外、基质在内的结构。提高基质细胞比例,可增强细胞系组装体的增殖;患者材料建立的组装体没有表现出相同关系。
样本来源的影响比药物分组更明显
作者比较辛伐他汀、伯氨喹、非诺洛芬与布洛芬,并在 24 小时药物处理后,对细胞和组装体进行整体 RNA 测序分析。不同材料类型形成的表达分组,比药物处理形成的分组更明显。
细胞系每种细胞和药物条件为 3 份样本,细胞系组装体每药物条件仅 1 份,原代组装体为 2 份。这些是各条件的测序样本数;原代材料的供者总数为 2 位患者。
不同模型对辛伐他汀的转录反应各异
论文报告辛伐他汀引起的表达变化最明显,并在上皮和基质细胞系中改变细胞因子与受体相关基因的表达。伯氨喹在上皮细胞中的转录变化较强,而在其他材料中的表现较弱。
通路分析显示,辛伐他汀和伯氨喹可使部分疾病相关基因集的变化方向逆转;非诺洛芬在基质细胞中抑制钙信号相关通路,布洛芬则未逆转研究所比较的异常通路。这里的“逆转”指基因集层面的变化,并非直接测量病灶消退或疼痛改善。
三维模型适合检验假设,样本量仍限制推断
这项工作将表达特征提出的候选带回人源模型,展示同一药物在不同材料中的反应可能不同。它有助于决定下一步应检验哪些细胞过程和实验终点。
研究样本很少,尤其细胞系组装体每种条件仅 1 份,限制了稳健统计比较。预印本尚未经过同行评议。