NAMs新方法学前沿

TDP43 变异神经元的 D-sorbitol 轴突运输比较(预印本版本)

在分隔近端与远端轴突的培养腔中,追踪线粒体/溶酶体形态、速度和位移,并比较 D-山梨醇(D-sorbitol)处理。

用途与模型

研究用途
检验人源 TDP43 变异神经元的细胞器运输表型及其小分子反应,为聚集之外的干预终点提供实验参照。
模型与细胞来源
TAR DNA 结合蛋白 43(TAR DNA-binding protein 43,TDP43)S393L 与 G294V 患者诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)来源运动神经元,设健康供者对照。
方法版本
2017 年 11 月 13 日 bioRxiv 预印本实验版本,未同行评议
实验形式
定向微流控培养腔分开轴突近/远端;成熟后期 40 mM D-sorbitol 处理 24 小时,活细胞成像追踪。

材料与平台

人源模型与分区
2 种患者变异模型与正常对照;比较较早和较晚成熟状态的近端、远端轴突。
小分子
D-sorbitol 为渗透调节剂;40 mM、24 小时用于运输/形态比较。
动态检测
双通道活细胞成像后用 TrackMate 分析线粒体与溶酶体速度、过程性位移,另检查形态及 TDP43 定位。

测量指标与分析

  • 线粒体/溶酶体平均速度与位移
  • 近端与远端细胞器形态
  • 图像中远端线粒体网络面积
  • TDP43 胞质定位及可见聚集

同一轴突位置比较正常/变异、培养年龄及处理;变异模型数据汇总,轨迹和细胞不作为独立供者数。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
较早/较晚培养正常和变异神经元,成熟后期未处理与 40 mM D-sorbitol 处理 24 小时比较。
测试范围
预印本结果称 2 位患者、3 位正常供者,方法另称 4 条正常细胞系;动态批次至少 3 次独立实验,图 6 列 n=3–5。每系/条件/位置每次至少 5 段视频,通常每视频 200–500 条轨迹。
参照体系
相应未处理模型、正常对照及轴突近端/远端位置。
研究结果
预印本报告远端变异网络图像面积从 117.2±2.93 升至 168.0±5.62 pixel²(均值±SEM),线粒体/溶酶体速度与位移接近正常;未诱导可见 TDP43 胞质聚集。

适用条件与研究局限

  • 方法依据 2017 预印本,未同行评议;2018 正式论文仅摘要核对,不将实验参数视为正式版已核。
  • 预印本结果写 3 位正常供者,方法写 4 条正常细胞系;这两项分别以供者和细胞系为单位。
  • 方法成像年龄写 14/32 天,结果概括 2/4 周,培养龄需结合原始实验确认。
  • pixel² 是图像网络面积,不是物理轴突长度;轨迹分母不能替代独立实验。

来源与原文

  1. Age-dependent neurodegeneration and organelle transport deficiencies in mutant TDP43 patient-derived neurons are independent of TDP43 aggregation原始研究 · bioRxiv (preprint, not peer reviewed) · 2017-11-13

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