NAMs新方法学前沿

合成肿瘤轨迹中时变净作用函数的机制约束推断

机制约束计算方法用于 PK/PD/QSP 参数和时变药效推断,以合成真值检验药物模型求解与隐藏函数恢复,属于模型方法质量而非临床疗效验证。

用途与模型

研究用途
演示部分观测下,如何结合已知方程恢复合成模型中的隐藏净作用函数。
模型与细胞来源
PhINs 教程 Example3 的灰箱模型:合成肿瘤细胞数 N 随时间变化,仅 N 被提供为观测,时变净作用 FD 作为隐藏输出恢复。
方法版本
2026 年原文版本;2026-09-22
实验形式
受控合成数据的算法验证;物理约束多层网络与 KAN 网络比较。

材料与平台

合成资料
已知增殖/死亡/数量约束模型产生的 N 轨迹,非患者、原代细胞或实际药物实验;保留 FD 已知真值供评价。
比较设置
观测数量 20 或 120、无噪声及 5% 噪声等教程设置;不同网络/残差采样和权重方案。
计算工具
原教程提供 PhINs 库及配套笔记本,用于示范模型训练与已知真值比较。

测量指标与分析

  • 细胞数量 N 的重建误差
  • 隐藏净作用 FD 的真值恢复误差
  • 方程约束与常规求解一致性检查

用已知合成真值分别评价观测量与隐藏函数,不能只看 N 的拟合;FD 包含细胞数量约束与增殖/死亡净作用,不当某临床药物独立杀伤率。

研究设计与结果

方法文件报告的验证结果

研究设计
方法教程 Table3 比较观测密度、噪声、网络架构和残差处理对合成 N 与 FD 恢复的影响。
测试范围
同一受控合成模型;20 或 120 观测,0% 或 5% 噪声等设置,不是 20/120 位患者。
参照体系
数据生成时已知 N 与 FD 真值,以及不同计算配置。
研究结果
120 观测/5% 噪声的表中,多层 PINN 的 N 与 FD RMSE 为 7.78×10⁻³/8.12×10⁻⁴,PIKAN 为 3.89×10⁻³/4.70×10⁻⁴;优劣仅对应这组设置。

适用条件与研究局限

  • 方法文件报告的合成基准,未验证实际临床或非临床药物反应。
  • 良好观测拟合不保证隐藏函数唯一,仍需可辨识性与机制核对。
  • 未据此声明 KAN 架构在其他数据或模型普遍更优。

来源与原文

  1. A Practical Tutorial on Physics-Informed Networks for Pharmacometrics and Quantitative Systems Pharmacology方法资料 · CPT: Pharmacometrics & Systems Pharmacology · 2026-09-22

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