27 个 MCF7 细胞株的药物反应与遗传差异比较
在不同来源的 MCF7 细胞株中比较单浓度药物抑制和浓度—反应曲线，再与遗传及表达差异配对。
用途与模型
- 研究用途
- 评价细胞株演化对候选药物筛选与实验重复性的影响。
- 模型与细胞来源
- 27 个 MCF7 乳腺癌细胞株；321 种初筛药物，33 种药物进入浓度验证。
- 方法版本
- 2018 年 NIH 接受作者稿相关主文（NIHMS977514）
- 实验形式
- 384 孔板，每孔 2500 个细胞，72 小时活力检测。
材料与平台
- 初筛与验证
- 初筛浓度 5 µM；后续 33 种药物对 27 个细胞株进行 8 点浓度测试。
- 检测和对照
- CellTiter-Glo 检测细胞活力，以溶剂对照归一化；硼替佐米或 MG132 用于实验阳性对照，不用作跨株统一归一化终点。
- 分子比较
- 基因组拷贝数、突变和表达资料与药物测试配对，另比较倍增时间。
测量指标与分析
- 细胞生长抑制百分比
- 浓度—反应曲线下面积（area under the curve，AUC）
- 分子状态与药物反应相关性
比较初筛与浓度—反应曲线、同一株系的技术重复、以及细胞株倍增时间与药物反应之间的相关性。
研究设计与结果
药物集评价
- 研究设计
- 比较同名细胞系不同株的 321 种药物反应。
- 测试范围
- 27 个 MCF7 株；55 种药物至少在一个株中抑制超过 50%。
- 参照体系
- 同一药物在不同株的反应，以及实验技术重复。
- 研究结果
- 55 种活性药物中 48 种也存在抑制不足 20% 的株；技术重复相关系数 0.97。
适用条件与研究局限
- 基因组和表达差异随来源及培养时间变化。
- 浓度—反应验证使用 33 种药物，初筛使用 321 种药物。
来源与原文
- Genetic and transcriptional evolution alters cancer cell line drug response原始研究 · Nature · 2018-08-08