肺癌多区域类器官来源细胞的 T 细胞与 NK 识别比较
比较同一患者不同区域及克隆亚系的类器官来源细胞，能否激活自体肿瘤浸润淋巴细胞（tumor-infiltrating lymphocytes，TIL）或健康供者自然杀伤（natural killer，NK）细胞。
用途与模型
- 研究用途
- 用于免疫治疗研发中的肿瘤异质性功能评价，识别区域或亚克隆差异，结合遗传背景解释免疫反应。
- 模型与细胞来源
- 3 名非小细胞肺癌患者、11 个区域模型与 81 条克隆亚系构成模型资源；自体 TIL 功能比较用于 2 名患者，健康供者 NK 比较用于另 1 名患者。
- 方法版本
- 2025 年正式论文多区域免疫识别比较
- 实验形式
- 三维类器官保存与扩增后，实际识别实验采用解离肿瘤细胞和免疫细胞的孔板共培养，检测活化标志及上清细胞因子。
材料与平台
- 功能比较条件
- 免疫细胞与肿瘤细胞比例为 2:1；T 细胞比较在 20–24 小时收集上清和细胞，NK 比较在 24 小时检测。
- 免疫识别指标
- 流式检测 CD8 阳性 T 细胞或 NK 细胞的 CD137，配合上清干扰素 γ（interferon-γ，IFN-γ）测量；NK 反应按未刺激背景校正。
- 比较与参照
- 分别比较不同区域、同一区域克隆亚系及强弱反应模型的混合物；第 1 名患者另有配对正常气道模型，反应检测设免疫细胞刺激阳性参照。
- 模型背景表征
- 全外显子组、染色体拷贝数及表达谱与免疫反应对应；NK 比较另检测 I 类主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex class I，MHC-I）表面表达。
测量指标与分析
- CD137 活化标志阳性比例
- IFN-γ 分泌
- MHC-I 表面表达与 NK 反应的关联
- 区域及克隆亚系的遗传和转录背景
将区域与克隆反应分别比较，并在 NK 混合效应模型中纳入供者和实验作为随机效应；表面 MHC-I 使用重复测量方差分析，相关性来自 5 个区域模型。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- 同一肿瘤的区域及克隆模型与自体 TIL 比较；第 3 名患者的区域模型与健康供者 NK 细胞比较，结合遗传/表达资料。
- 测试范围
- 模型资源为 3 名患者、11 个区域、81 条克隆亚系。图 2B 区域 TIL 反应：患者 1 n=4–7、患者 2 n=3；上清 IFN-γ n=2–3，R7 所选克隆反应 n=3–5。图 6 NK 功能分析为 4 位供者、5 次实验，CD137 各区域 n=8–10、IFN-γ n=10；MHC-I 表面检测 n=3。
- 参照体系
- 不同区域与同一区域克隆亚系；单独与混合的强弱反应模型；免疫细胞背景、阳性刺激和第 1 名患者正常气道参照。
- 研究结果
- 2 名患者的 TIL 比较均有区域或亚克隆差异；第 3 名患者 R5 引起较弱 NK 活化并有较高 MHC-I。5 区域模型 MHC-I 与 NK 活化相关系数 −0.95，p=0.014；基因/表达资料未能单独识别前 2 名患者的 T 细胞逃逸亚克隆。
适用条件与研究局限
- 功能检测集中在免疫识别与活化，未比较具体免疫检查点药物的剂量反应，也未以直接肿瘤细胞裂解率作为该版本主要终点。
- 建立尝试涉及 42 名患者、166 区域，7 名患者至少 1 个区域成功，4 名患者多区域成功；其中 1 名模型增殖减慢，最终功能研究为 3 名患者。
- 类器官与原组织仍有部分变异差别，可能涉及取样片段或建模选择性生长。
- 共培养主要分离肿瘤细胞固有的识别差异，原肿瘤复杂基质与其他免疫细胞的影响未被完整保留。
来源与原文
- Subclonal immune evasion in non-small cell lung cancer原始研究 · Cancer Cell · 2025-07-03