肺癌类器官的遗传与免疫形态纯度核查
结合拷贝数、原肿瘤变异及免疫组织化学（immunohistochemistry，IHC），识别肺癌类器官培养物中的正常气道细胞过度生长。
用途与模型
- 研究用途
- 在个体化抗癌药物评价前核查模型身份，并在扩增期间复核肿瘤纯度。
- 模型与细胞来源
- 人非小细胞肺癌的肺内病灶类器官，以正常气道类器官和肺外病灶来源肿瘤类器官为参照。
- 方法版本
- 2020 年肺癌类器官身份核查比较
- 实验形式
- 拷贝数分析比较 20 个肺内病灶类器官、5 个正常气道类器官和 5 个肺外病灶肿瘤类器官；可用模型另核对变异、形态及标志分布。
材料与平台
- 遗传参照
- 原肿瘤已有变异；配对血液提供胚系参照。主要用单核苷酸多态性（single-nucleotide polymorphism，SNP）阵列 Cyto-SNP850k 分析拷贝数，部分模型另用全基因组测序。
- 形态与标志
- 组织形态结合 p63 的空间分布、甲状腺转录因子 1（thyroid transcription factor 1，TTF-1）和细胞角蛋白 5/6（cytokeratin 5/6，CK5/6）染色。
测量指标与分析
- 拷贝数异常及与原肿瘤变异的一致性
- 囊性/实性形态与 p63 极性分布
- 正常气道细胞过度生长和纯肿瘤培养物建立率
遗传结果与形态、标志分布交叉判断。拷贝数阵列与测序采用各自分析流程；建立率分析的 58 份标本与 20 个肺内病灶遗传分析对象分别统计。
研究设计与结果
方法可行性研究
- 研究设计
- 在研究队列内比较正常气道、肺内病灶及肺外病灶模型，并用原肿瘤变异和免疫形态交叉核查。
- 测试范围
- 拷贝数比较为 20、5、5 个类器官；建立率分析另为 58 份标本。
- 参照体系
- 正常气道类器官、肺外病灶来源肿瘤类器官，以及对应原肿瘤变异。
- 研究结果
- 肺内病灶的 16/20 个类器官拷贝数正常；部分培养物缺失原肿瘤变异，并呈正常气道的 p63 极性分布。58 份标本中有 24 份形成培养物，其中 14 份疑为正常气道类器官，作者报告纯肿瘤建立率为 17%。
适用条件与研究局限
- 部分肺癌本身拷贝数接近正常，需结合原肿瘤变异。
- 正常和肿瘤类器官都可呈囊性或实性；TTF-1 阳性也可见于正常气道。
- CK5/6 在部分基底样鳞癌中可表达，p63 与形态组合的分类思路仍需独立队列验证。
来源与原文
- Challenges in Establishing Pure Lung Cancer Organoids Limit Their Utility for Personalized Medicine原始研究 · Cell Reports · 2020-05-05