NAMs新方法学前沿

LoVo 细胞损伤与细胞周期数据驱动的 ATR 药代药效模型

以细胞核计数、DNA 损伤标志物和撤药后的恢复数据拟合细胞周期模型,再加入肿瘤结构与药物暴露。

用途与模型

研究用途
比较 ATR 抑制剂 AZD6738 单药及联合放疗的暴露时程与肿瘤反应。
模型与细胞来源
LoVo 人结直肠癌细胞系的体外实验与细胞周期常微分方程模型;ATR 是参与 DNA 损伤应答的激酶。
方法版本
2015 年 AZD6738 浓度与撤药实验模型
实验形式
96 孔板浓度—时间与撤药实验,细胞周期和复制压力状态建模,再纳入肿瘤结构及药代曲线。

材料与平台

细胞与培养
LoVo 细胞,每孔 5000–10000 个起始活细胞;DMEM、10% 胎牛血清,培养 24 小时后处理。
药物与放射处理
AZD6738 0.3–30 μM 的 5 点浓度系列,培养液及 0.1% DMSO 对照;另用 2 Gy X 射线处理。
撤药设计
作用约 16 小时后洗涤,换入 200 μL 预温培养液,继续观察损伤信号与细胞数量。
检测
γH2AX 免疫荧光、核计数、10 μM 条件的细胞周期分布及 24 小时 caspase-3;后续与 LoVo 小鼠移植瘤资料比较。

测量指标与分析

  • γH2AX 信号超过预设阈值的细胞占孔内细胞的比例
  • 图像细胞核数量
  • G1/S/G2-M 细胞分布
  • caspase-3 信号
  • 模型预测肿瘤体积

以 γH2AX 和细胞计数浓度—时间曲线拟合损伤与修复速率,加入撤药后恢复数据,再用独立细胞周期与后续肿瘤结果检验模型预测。

研究设计与结果

药物集评价

研究设计
体外剂量与撤药数据拟合,另检查细胞周期分布,并在加入药代和肿瘤结构后与动物结果比较。
测试范围
细胞实验图 2 的条件各有 6 个培养重复;细胞系为 LoVo,后续采用其小鼠移植瘤。
参照体系
未处理与 DMSO 对照、持续与撤药暴露、不同药物浓度及移植瘤单药或联合放疗结果。
研究结果
持续暴露中 γH2AX 与细胞计数拟合 R² 分别为 0.77、0.72,撤药后两项均为 0.87;10 μM 下 S 期增加、G2/M 减少的趋势与模型相符。后续移植瘤比较支持整体变化趋势。

适用条件与研究局限

  • γH2AX 是损伤相关信号,模型同时使用细胞计数与细胞周期,未逐一描述全部细胞死亡机制。
  • 模型围绕 LoVo 和 AZD6738 建立,DNA 修复通路交互被简化。
  • 人体剂量和时序属于模型辅助设计,研究直接验证仍以细胞实验和动物资料为主。

来源与原文

  1. Bridging the gap between in vitro and in vivo: Dose and schedule predictions for the ATR inhibitor AZD6738.原始研究 · Scientific Reports · 2015-08-27

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