人视网膜类器官的细胞组成与发育阶段质控
以分阶段单细胞表达与成人视网膜参照,检查类器官的细胞身份、组成和成熟特征。
用途与模型
- 研究用途
- 为视网膜疾病及药物研究选择适当细胞与培养阶段;本文未建立药物预测性能。
- 模型与细胞来源
- 23 条人诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)系先筛查;主要转录分期为 F49B7,部分实验采用 IMR90.4。成人参照为 4 位供者的 8 只眼。
- 方法版本
- 原论文实际模型质量评价版本
- 实验形式
- 比较 6–38 周类器官表达、另检查 46 周,并与成人周边及中央凹视网膜比较。
材料与平台
- 模型
- 人 iPSC 来源多层视网膜类器官与成人视网膜参照。
- 检测
- 单细胞 RNA 测序、细胞标志及形态检查;表达分布和细胞类型比较。
测量指标与分析
- 细胞类型组成
- 相邻发育阶段表达分布差异
- 成人周边与中央凹相似度
- 疾病基因的细胞类型与时间分布
分别检查细胞是否存在、比例是否稳定与该类细胞的表达水平;成人参照的取材状态单独考虑。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- 比较 6–38 周类器官表达、另检查 46 周,并与成人周边及中央凹视网膜比较。
- 测试范围
- 全部类器官 110,862 个细胞;主要 F49B7 6–38 周分析 62,136 个细胞;成人 174,579 个细胞来自 4 供者 8 眼。
- 参照体系
- 不同培养年龄、同龄同批类器官以及成人不同视网膜区域。
- 研究结果
- 表达在 30–38 周趋于稳定,更接近成人周边视网膜;46 周部分细胞多样性和标志下降。
适用条件与研究局限
- 详细结果集中于少数可形成稳定分层的细胞系。
- 成人与类器官的表达和形态仍有差距,晚期神经节细胞少。
- 模型质量参照未验证广泛药物反应预测。
来源与原文
- Cell Types of the Human Retina and Its Organoids at Single-Cell Resolution原始研究 · Cell · 2020-09-17