NAMs新方法学前沿

肿瘤球状体预选、光片成像与单细胞组成质量检查

用二维预选及三维单细胞分析检查球状体的大小、形状、组成与成像一致性。

用途与模型

研究用途
为三维肿瘤药筛提供模型与检测流程的质量评价;验证范围为成像和样本分析。
模型与细胞来源
HeLa Kyoto 单培养及 HeLa Kyoto/MRC-5 人源共培养球状体;T-47D 人乳腺癌球状体用于成像比较。
方法版本
2025 年 SpheroidPicker/FEP 成像孔板/BIAS 三维分析版本
实验形式
二维形态预选与样本转移后,在氟化乙烯丙烯共聚物(fluorinated ethylene propylene,FEP)薄膜孔板上进行光片荧光显微成像(light-sheet fluorescence microscopy,LSFM),再用 Biology Image Analysis Software(BIAS)分析单细胞。

材料与平台

模型与组成
主要单培养与共培养模型在 48 小时固定;共培养 HeLa Kyoto:MRC-5 起始接种比例为 1:4。
成像与分析
SpheroidPicker、FEP 薄膜定点孔板、光片成像与 BIAS 图像分析;同时检查大小和形状,三维图像用于细胞分割和分类。

测量指标与分析

  • 二维大小与形状
  • 三维体积、形状及细胞数
  • 细胞类别比例与局部空间关系
  • 图像强度方差
  • 准备、校准和成像耗时

区分操作人员、重复实验、球状体和分割对象层级;评价二维/三维指标与实际细胞组成是否一致。细胞分类器以两类各 750 个标注对象训练,10 折交叉验证平均准确率为 98.59%,该性能限于标注数据内的交叉验证。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
多操作人员重复制备、物镜比较、孔板与传统成像比较及单细胞组成分析。
测试范围
3 名操作人员各 3 次实验,二维共 223 单培养/203 共培养;三维 110/114;成像质量每组 5,时间比较每组 10。
参照体系
单培养/共培养、不同倍率、孔板/毛细管包埋、二维/三维。
研究结果
图像质量无显著差异,孔板 10 样本总耗时 48 ± 7 分钟、传统方式 102 ± 9 分钟。114 共培养中 72 为 MRC-5 多数、28 为 HeLa Kyoto 多数、14 相等,实际组成与统一起始比例不同。

适用条件与研究局限

  • 没有治疗药物效力、患者药敏或临床预测验证。
  • 二维相似不能保证三维结构/细胞组成一致。
  • 主要固定模型为单时间点,细胞/基质复杂度有限。

来源与原文

  1. HCS-3DX, a next-generation AI-driven automated 3D-oid high-content screening system原始研究 · Nature Communications · 2025-10-07

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