单细胞预测与乳腺癌移植瘤来源类器官的候选药物比较
整合乳腺癌单细胞资料，确定内分泌治疗后保留的细胞群，再用 4 个患者来源移植瘤衍生类器官（patient-derived xenograft organoids，PDxO）比较候选药物。
用途与模型
- 研究用途
- 把细胞群的转录特征用于候选排序，并通过类器官功能比较检验模型特有和共有细胞群的干预线索。
- 模型与细胞来源
- HCI003、HCI017、UIC013、UIC020 四个 PDxO 模型；FELINE 试验的 9 份肿瘤治疗前后单细胞资料为另一数据组。
- 方法版本
- bioRxiv v1；2026-09-16
- 实验形式
- 单细胞差异丰度与 DREEP 药物评分后，进行 14 天类器官面积及剂量反应比较，并用增殖检测补充。
材料与平台
- 模型及比较
- 4 个 PDxO 模型与 FELINE 试验 9 份肿瘤为独立资料组；DREEP（Drug Estimation from single-cell Expression Profiles）对 450 种药物计算评分。
- 评价指标
- 类器官面积、增殖及剂量反应曲线；模型特有与共有细胞群的转录评分。
测量指标与分析
- 类器官面积、增殖及剂量反应曲线
- 模型特有与共有细胞群的转录评分。
达沙替尼和 pluripotin 对 UIC013 的生长抑制较强；vandetanib 和 saracatinib 的模型间差异较有限，AZD8055 在所比较模型中反应相近。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- DREEP 对每个不敏感细胞群计算 450 种药物的评分，再选取候选物进行类器官剂量反应比较。
- 测试范围
- 4 个 PDxO 模型；剂量反应按药物开展 2 或 3 次独立生物学实验。9 份 FELINE 临床肿瘤为另一数据组。
- 参照体系
- 候选物处理与相应对照；UIC013 与其余 PDxO 模型的曲线下面积比较。
- 研究结果
- UIC013 对达沙替尼和 pluripotin 更敏感；AZD8055 的多模型反应相近，部分其他候选物的模型间差别较弱。
适用条件与研究局限
- 450 项为计算评分范围，并非全部在类器官内实测。
- PDxO 经过移植瘤阶段；临床肿瘤和类器官不是同一 9 位患者的配对验证。
- 当前没有个体处方预测验证。