DrugReflector 转录排序与人源造血细胞表型复核
用转录特征排序小分子，在人 CD34 细胞中复核巨核/红系分化并反馈更新特征。
用途与模型
- 研究用途
- 提高表型候选发现效率，并区分模型排序性能、实验命中和供者复测。
- 模型与细胞来源
- DrugReflector 集成模型及人 CD34 阳性造血干/祖细胞；不同谱系与供者另列。
- 方法版本
- 2025 年人 CD34 阳性细胞药筛及一轮转录特征反馈版本
- 实验形式
- CMap 特征训练、候选排序、流式分化表型、多供者复测和转录—表型反馈。
材料与平台
- 筛选比较
- 巨核谱系候选化合物分别测试 100 nM、1 μM、10 μM；记录无细胞毒性时的最大诱导作用，模型推荐与随机选物比较。
- 实测终点
- 流式检测 CD41a 阳性/CD71 阴性/CD42b 阳性的巨核细胞群；活细胞数过滤与相对 DMSO 的阈值分开，第 7 天巨核表型及转录特征另列。
- 反馈版本
- 12 命中/8 未命中，4 转录时点；96 新候选 85 过 QC/22 命中。
测量指标与分析
- 谱系诱导命中率
- 正确化合物进入前 1% 的召回指标
- 多供者复测
- 按排名范围的命中效率
命中阈值与模型召回指标分别报告，复测及质量过滤后的分母单列。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- 推荐与随机选物的人 CD34 药筛，巨核/红系及一轮主动特征更新。
- 测试范围
- 巨核 21/107 vs 1/87；红系 13/81 vs 1/85；供者复测与 22/85 新验证另列。
- 参照体系
- 随机选物、DMSO、未命中物、原始/更新特征及打乱特征。
- 研究结果
- 初轮命中率约 17/13 倍；更新后 top 100 区域约 2 倍，供者复测并非全部一致。
适用条件与研究局限
- 命中率衡量候选在该细胞实验中达到预设阈值的比例，尚无患者临床获益验证。
- CMap 主要癌细胞/978 基因限制外部适用性。
- 初轮复测并非所有候选在两位额外供者中均命中，供者差异须单独评价。
来源与原文
- Active learning framework leveraging transcriptomics identifies modulators of disease phenotypes原始研究 · Science · 2025-10-23