NAMs新方法学前沿

透明细胞肾癌免疫与靶向治疗反应评分的跨队列评价

以透明细胞肾癌转录组及部分分子规则,分别估计免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitor,ICI)相关方案与酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的反应,并在既有治疗队列检验。

用途与模型

研究用途
研究计算生物标志物对 ICI/TKI 药物反应分层及方案比较的用途,不视为已前瞻验证的临床选药工具。
模型与细胞来源
3621 样本建立 5 类微环境;ICI 模型为转录特征梯度提升加分子非应答规则,TKI 模型为 3 组特征逻辑回归。
方法版本
2025 年 HiTME 分类、ICI 梯度提升和 TKI 逻辑回归版本
实验形式
采用已注释实体瘤疗效评价标准(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors,RECIST)反应及生存的治疗队列分别拟合与评价,两类分数组合成决策树后进行既有治疗组比较。

材料与平台

分型与机构资料
14 数据集 3621 样本用于微环境分类;WU-RCC193 份机构样本还含未接受系统治疗的监测者,不同用途取不同子集。
ICI 评分
完全缓解/进展病例训练;部分缓解/稳定在后续评价;部分抗原呈递、雷帕霉素靶蛋白相关基因和肌生成规则赋零分并排除拟合。
TKI 评分
TKI 来源队列共 240 例舒尼替尼病例,其中 178 例疾病稳定者未用于拟合;模型使用巨噬细胞、血管生成和增殖特征。验证队列汇总 822 例,反应分类按可评价的完全/部分缓解与进展病例检验。

测量指标与分析

  • 真实 RECIST 反应
  • 各评分分组无进展生存
  • TKI 验证 AUC
  • 两类评分跨治疗适用性
  • 双评分分层下不同方案比较

分型样本与药物模型子集分开;分子规则与学习得分分开;含 ICI 的联合方案不当作免疫单药验证。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
跨公开试验和机构队列分别验证 ICI/TKI 评分,并在既有治疗组内分析双评分分层。
测试范围
微环境分类 3621 份样本;WU-RCC193 份含未接受系统治疗者;TKI 来源 240 例,其中 178 例疾病稳定者未拟合,另有 822 例验证来源资料。ICI 训练先选完全缓解/进展,再依分子规则筛选。
参照体系
实际完全/部分缓解与进展;不同治疗队列;舒尼替尼和 ICI 相关联合方案。
研究结果
TKI 验证区分完全/部分缓解与进展受试者工作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristic curve,AUC)为 0.74;两类评分不能跨治疗互相预测;偏向 TKI 组的 14 对 10 月比较 p=0.06。

适用条件与研究局限

  • 无按模型分配治疗的前瞻验证。
  • ICI 模型部分训练/验证为抗血管联合,不能分离单药效果。
  • 免疫模型的人数受反应类别与分子规则筛选影响;原文部分免疫模型指标归属及风险比符号不一致,不能合并成统一性能值。
  • 批次标准化可能掩盖生物差异,治疗/人群与可用注释资料有偏倚。

来源与原文

  1. AI-driven multimodal algorithm predicts immunotherapy and targeted therapy outcomes in clear cell renal cell carcinoma原始研究 · Cell Reports Medicine · 2025-08-19

相关资讯与知识

自定义隐私设置

必要设置始终启用

用于记住你的隐私选择。文章原站配图会向图片提供方发起请求,详见隐私政策。