膀胱癌类器官分病期药敏与基因关联比较
研究在患者来源膀胱癌类器官中比较标准治疗药物与靶向药反应。非肌层浸润性和肌层浸润性模型呈现不同药敏分布，基因组分析提出 FGFR1 信号与拉帕替尼反应的关联。
用途与模型
- 研究用途
- 比较标准治疗药物和靶向药的体外反应，并将药敏与模型基因改变对应。
- 模型与细胞来源
- 不同病期患者来源膀胱癌类器官；药筛图 5 汇总 19 份生物样本，具体药物可用模型数量不同。
- 方法版本
- 2023 年原研究版本
- 实验形式
- 患者来源类器官在 384 孔板进行药物处理，每个处理条件至少 3 个技术重复孔，溶剂/未处理条件平均约 7 孔；处理 48 小时后以发光细胞活性读数计算每份样本相对溶剂对照的 z-score。
材料与平台
- 人源类器官模型
- 不同病期患者来源膀胱癌类器官；药筛图 5 汇总 19 份生物样本，具体药物可用模型数量不同。
- 药物处理
- 类器官培养后接受 48 小时药物处理；标准治疗药物包括表柔比星和顺铂/吉西他滨组合，靶向药包括拉帕替尼等。
测量指标与分析
- 药物处理后细胞活性相对溶剂对照的 z-score
- 敏感性分组
- 基因变异与药敏的统计关联。
图 5a 的 19 份生物样本构成药物反应热图。有效判定为 z-score ≤ −1.5 且校正后 P 值 ≤ 0.05；图 5b–d 联合基因改变和药敏分析。拉帕替尼分母为非肌层浸润 10 份与肌层浸润 8 份，不能把技术孔当独立患者。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- 患者来源类器官在 384 孔板进行药物处理，每个处理条件至少 3 个技术重复孔，溶剂/未处理条件平均约 7 孔；处理 48 小时后以发光细胞活性读数计算每份样本相对溶剂对照的 z-score。
- 测试范围
- 药筛图 5 汇总 19 份生物样本，各药物的可用模型数不同；拉帕替尼比较包括 10 份非肌层浸润性和 8 份肌层浸润性模型。
- 参照体系
- 非肌层浸润与肌层浸润模型分别比较相应标准治疗药物及拉帕替尼；临床记录仅逐例对应。
- 研究结果
- 非肌层浸润性与肌层浸润性模型呈现不同药敏分布；拉帕替尼分别在 5/10 与 4/8 份模型中有显著活性，FGFR1 信号关联经多重检验后保留 FDR 0.02。临床记录中的个例对应未形成整队列预测性能。
适用条件与研究局限
- 属于体外药物反应和基因关联研究；样本、药物及病期各有不同分母，单例治疗对应不表示获得临床预测资格。
来源与原文
- Bladder cancer organoids as a functional system to model different disease stages and therapy response原始研究 · Nature Communications · 2023-04-18