NAMs新方法学前沿

按血浆 NFL 分组比较 ALS 患者神经元表达

按参与者基线血浆神经丝轻链(neurofilament light chain,NFL)分组,比较患者来源运动神经元与健康供者的基因表达。

用途与模型

研究用途
解释候选药物试验中患者分组的细胞分子背景,为后续分层研究提供线索。
模型与细胞来源
模型采用 9 名肌萎缩侧索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)患者的诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)来源运动神经元,另以 6 名无神经系统症状及相关家族史的健康供者细胞作对照。
方法版本
2022 年 iDReAM 一期研究内的探索性细胞表征
实验形式
人源运动神经元培养与单细胞 RNA 测序,结合各供者的临床血浆指标分组分析。

材料与平台

参与者来源运动神经元
临床基线血浆 NFL 低于 100 pg/mL 的患者 5 名,不低于该值的患者 4 名;细胞来源为患者血细胞建立的 iPSC。
健康供者参照
6 名健康供者来源 iPSC 运动神经元;与 ALS 组共同用于疾病相关表达及后续组间比较。

测量指标与分析

  • 患者与健康供者运动神经元的表达差异
  • 高、低 NFL 患者组的基因表达差异
  • ALS 相关通路富集
  • 神经元状态的拟时序分布

先比较 ALS 与健康供者的运动神经元表达,再比较患者高、低 NFL 组,并从疾病相关差异基因中检查两类患者的分子特征。

研究设计与结果

临床关联研究

研究设计
在同一一期研究中,按患者基线 NFL 分组,把临床指标与各供者神经元的单细胞表达进行对应比较。
测试范围
9 名患者和 6 名健康供者;患者低 NFL 组 5 名,高 NFL 组 4 名。
参照体系
健康供者运动神经元,以及低 NFL 与高 NFL 患者组。
研究结果
MEG3、NKX6-2、TEAD1、TFAP2A 在患者与健康供者以及高、低 NFL 患者神经元之间表现出表达差异,作者用于讨论患者分组的分子背景。

适用条件与研究局限

  • 研究内事后探索,没有独立队列检验临床分组或药物响应预测。
  • 本次细胞分析比较分子状态,没有报告同批细胞的博舒替尼处理药敏。
  • 低基线 NFL 也可能与较慢自然进展相关;临床部分为无安慰剂的开放小样本研究。

来源与原文

  1. Safety and tolerability of bosutinib in patients with amyotrophic lateral sclerosis (iDReAM study): A multicentre, open-label, dose-escalation phase 1 trial原始研究 · eClinicalMedicine · 2022-10-25

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