NAMs新方法学前沿

晚期肺腺癌类器官靶向药测试与二维培养比较

将三维类器官药敏与临床结局比较,并测试二维转换是否改变反应。

用途与模型

研究用途
研究晚期肺癌分子背景、培养条件及靶向治疗反应的关系。
模型与细胞来源
83 个肿瘤类器官与 1 个正常样模型;临床对应 9 名患者,二维转换 5/9 成功。
方法版本
原研究首次正式发表版本
实验形式
Matrigel 三维培养、超低吸附 96 孔药筛;胶原平板作二维转换。

材料与平台

建立与培养
48 孔板每 20 µL Matrigel 约 2,000 个细胞,覆盖 250 µL 气道类器官培养液;R-spondin1、FGF7、FGF10、Noggin、N-acetylcysteine、nicotinamide、A83-01、SB202190,初 2 天加 Y-27632。
短期药筛
解离后培养 5–10 天,释放类器官后在含 5% Matrigel 的 AdDF+++ 培养液中转至超低吸附 96 孔板,每孔接种 2,500 个类器官,1 小时后给药。临床比较用相应靶向药 100 nM 处理 3 天,CellTiter-Glo 3D 测 ATP。
重复与长暴露
IC50 使用 3 次生物学重复,每次 3 个技术重复;敏感阈值 IC50<100 nM。48 孔长期试验每孔约 250 个类器官,每 3 天换药液、最长 15 天,ATP 相对于第 0 天计算。
二维转换
三维碎片置于胶原包被平板,1 个月内得到可传代二维培养;可再用 Matrigel 转回三维,保留同一 AO 培养液背景。

测量指标与分析

  • IC50
  • ATP 活力相对于第 0 天变化
  • PFS 与影像反应
  • Src/STAT3 磷酸化
  • 二维转培养成功率

将匹配模型的 3 天靶向药反应与临床 PFS 及 RECIST 反应比较;同源二维/三维/二维再转三维模型比较 IC50 与信号。

研究设计与结果

临床关联研究;实验条件比较

研究设计
回顾性地对应模型药敏与患者后续 TKI 结局。
测试范围
9 名患者;8 名可按 9 个月 PFS 分组,另 1 名截止时仍在治疗。
参照体系
相应模型未用药条件、用药前第 0 天;患者临床 PFS 及影像。
研究结果
5 名无进展生存期超过 9 个月者,4 个模型敏感;3 名低于 9 个月者,2 个模型耐药,一致率 75%。

适用条件与研究局限

  • 临床样本少且为回顾性分析,检测有效时间窗尚需前瞻性验证。
  • 部分具体治疗为单例或少量模型;BRAF 临床患者具有多个变异克隆且随访短。

临床关联研究;实验条件比较

研究设计
将 9 个临床匹配三维模型转换二维,部分再转回三维。
测试范围
5 个成功二维模型,2 个的药敏与三维不同。
参照体系
同来源三维/二维培养,保留气道培养液背景。
研究结果
YUO-004 二维培养对吉非替尼较敏感,转回三维后 IC50 升高;Src 抑制可增加其吉非替尼反应。

适用条件与研究局限

  • 4/9 模型无法维持二维培养,培养形式改变可用样本集合。
  • Src 相关变化和药物效应的比较主要来自 YUO-004 与 YUO-050 两个模型。

来源与原文

  1. Modeling Clinical Responses to Targeted Therapies by Patient-Derived Organoids of Advanced Lung Adenocarcinoma原始研究 · Clinical Cancer Research · 2021-06-03

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