从代谢变化筛选候选酶，再作计算排序
新加坡南洋理工大学（Nanyang Technological University）团队在 2021 年报告一种小分子酶靶点发现策略：先结合代谢组和脂质组变化选择相关酶，再以分子对接比较结合倾向。作者将其用于药物发现与毒性机制研究的靶点寻找。
论文以磷酸三苯酯（triphenyl phosphate，TPhP）这一参考化学物展示流程。摘要报告 51 种相关代谢酶进入排序，其中 25 个蛋白的预测亲和力高于对应内源底物。该结果属于计算比较。
两个候选酶获得结合实验支持
羟酰基辅酶 A 脱氢酶（hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase，HADH）和 3-羟酰基辅酶 A 脱氢酶 2 型（3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2，HSD17B10）另经表面等离子体共振（surface plasmon resonance，SPR）与等温滴定量热（isothermal titration calorimetry，ITC）检测。摘要报告两者与 TPhP 的解离常数处于低微摩尔量级。
这一路径为药物发现中的靶点筛选提供方法线索；本次示例采用参考化学物，结合证据来自所测的 2 个酶。