NAMs新方法学前沿

RPGR 同遗传背景类器官的结构与电生理比较

先纠正患者 iPSC,再分化视网膜类器官,分阶段比较感光细胞、连接纤毛和膜片钳电流。

用途与模型

研究用途
比较 RPGR 变异纠正前后的患者来源视网膜模型,评价感光细胞结构及功能变化。
模型与细胞来源
RPGR 患者 1 的 c.1685_1686delAT 变异背景、诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)纠正克隆与健康对照;建系总范围为 3 名患者及 3 名健康供者。
方法版本
2018 年患者 1 iPSC 基因纠正与视网膜类器官验证版本
实验形式
悬浮三维视网膜分化;22 周结构和表达比较,36 周类器官外层细胞膜片钳。

材料与平台

基因纠正
pX330 携带 sgRNA;正常对照 DNA 构建 3.4 kb 同源模板及新霉素筛选盒。两载体经 LONZA 4D 电转,G418 筛选,PCR 和测序确认。
视网膜分化
悬浮培养按时加入 BMP4,形成类器官并长期培养;用健康、患者与纠正背景分别比较。
电流记录
24 或 36 周类器官置记录室,用 95% O2/5% CO2 平衡 Ames 液灌流;外层小细胞全细胞膜片钳,电极 4–7 MΩ,Alexa Fluor 555 50 μM 标记;1 kHz 滤波、20 kHz 采样。
结构与表达
Recoverin 及视蛋白染色、Arl13b/GT335 纤毛标志、HCN-1 染色和分期 RNA 测序;ZD7288 用于验证 HCN 相关电流。

测量指标与分析

  • 感光细胞数量及形态
  • 连接纤毛长度
  • 感光细胞相关表达
  • 超极化激活电流 Ih
  • HCN-1 表达和定位
  • TUNEL 及 caspase-3

按培养时间和细胞背景分别比较结构与表达;膜片钳生成电流—电压关系并检验 HCN 阻断响应。纤毛与细胞数量按对应图的类器官/细胞层级分析。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
患者、健康与同背景纠正类器官比较,配合 HCN 阻断、纤毛和基因表达检测。
测试范围
患者 1 纠正实验确认 2 克隆;36 周电流图健康 24 细胞、患者 21、纠正 15,3 次独立实验;主要结构图每类 3 类器官。
参照体系
未纠正患者 1、健康对照及纠正背景;ZD7288 处理为电流参照。
研究结果
纠正后感光细胞数量和形态改善;连接纤毛长度由患者 1.700 μm 改善至 2.125 μm,对照 2.112 μm。Ih 及 HCN-1 表达改善;caspase-3 未明显改变。

适用条件与研究局限

  • 核心纠正比较限患者 1 遗传背景,不同检测的供者、细胞或类器官数不同。
  • 结构、转录与电流在不同培养阶段检测。
  • 检测终点为体外细胞表型、电流及表达;细胞减少的具体机制仍为研究线索。

来源与原文

  1. Gene Correction Reverses Ciliopathy and Photoreceptor Loss in iPSC-Derived Retinal Organoids from Retinitis Pigmentosa Patients原始研究 · Stem Cell Reports · 2018-03-08

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