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MPNST 细胞身份资料与司美替尼、JQ1 药敏比较

在恶性周围神经鞘瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor,MPNST)模型中结合身份和分子分类,比较司美替尼及 JQ1 的活力影响。

用途与模型

研究用途
比较神经纤维瘤病 1 型(neurofibromatosis type 1,NF1)相关与散发病例来源细胞系的药物反应,并结合多梳抑制复合物 2(polycomb repressive complex 2,PRC2)等分子特征分析。
模型与细胞来源
身份检查从 9 个常用细胞系开始;排除 T265 后,保留 5 个 NF1 相关与 3 个散发来源模型。
方法版本
原研究正式主文
实验形式
96 孔板,接种 24 小时后加药,药物作用 48 小时。

材料与平台

细胞材料
模型在含 10% 胎牛血清及 2 mM 谷氨酰胺的高糖 DMEM 培养;每孔 2000–10000 细胞。
药物和检测
司美替尼与 BET(bromodomain and extra-terminal)蛋白家族抑制剂 JQ1 均使用 0.064–40 µM、5 倍梯度;噻唑蓝四唑溴盐(thiazolyl blue tetrazolium bromide,MTT)比色法测量,溶剂对照归一化。
身份资料
短串联重复序列、倍性、拷贝数、全基因组/外显子组、DNA 甲基化和 SOX9/SOX10/S100B 资料与药敏配对。

测量指标与分析

  • 归一化细胞活力
  • 药物浓度—反应
  • 细胞身份与甲基化分类

将各细胞系的药物浓度—活力曲线与身份鉴定、甲基化分类及分子资料配对,比较 5 个 NF1 相关模型与 3 个散发病例来源模型。

研究设计与结果

药物集评价

研究设计
已鉴定模型接受两种药物浓度测试。
测试范围
5 个 NF1 相关模型与 3 个散发来源模型。
参照体系
相应溶剂对照及不同模型的药物反应。
研究结果
司美替尼和 JQ1 对 NF1 相关模型的活力抑制总体强于 3 个散发来源模型。

适用条件与研究局限

  • 散发来源 3 个模型的原肿瘤不全可得,替代诊断为综合资料提出的解释。
  • 模型数量少,不能覆盖全部 MPNST 遗传谱。
  • 本药敏比较没有临床治疗结局验证。

来源与原文

  1. Deep genomic analysis of malignant peripheral nerve sheath tumor cell lines challenges current malignant peripheral nerve sheath tumor diagnosis原始研究 · iScience · 2023-01-31

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