NAMs新方法学前沿

低级别浆液性卵巢癌细胞 panel 选择性筛选

肿瘤细胞系与正常卵巢上皮参照并行筛选,通过图像细胞计数和分层筛选缩小候选名单。

用途与模型

研究用途
罕见卵巢癌候选药物筛选、细胞选择性比较及复测设计。
模型与细胞来源
12 个患者来源 LGSOC 细胞系和 1 个 IOSE-523 正常卵巢上皮参照细胞系。
方法版本
2024 年 12 个 LGSOC 模型/IOSE-523 研究版本
实验形式
384 孔、72 小时处理、DAPI 全孔成像;预筛药库经筛减后进行主要筛选,候选另行购入复测。

材料与平台

肿瘤与对照细胞系
M199/MCDB105 培养,各模型先用 IncuCyte 测生长并确定接种量。
自动液体工作站与 CellInsight CX7
药物处理后核染色成像,每孔 9 个视野覆盖孔底。
CellProfiler 4.1.3 与数据流程
核分割、Loess 板位校正、DMSO 归一和 robust Z 分数,按模型设置图像参数。

测量指标与分析

  • 核计数/归一细胞数
  • robust Z 分数
  • 肿瘤与参照反应
  • 不同浓度选择性
  • 重新购药的复现结果

结合肿瘤模型覆盖、低浓度效应与对照反应分层选候选;10 µM 初筛信号普遍毒性较强,主要选择分析聚焦较低浓度。

研究设计与结果

方法可行性研究

研究设计
先导药库筛减、多个细胞系主要筛选和独立药品批次的二次检测。
测试范围
预筛 6,710 项药库条目在 3 个肿瘤模型和 1 个对照开展;后续药库为 3,436 个分子。79 个候选在 4 个肿瘤模型复测。
参照体系
DMSO、阳性药物、正常上皮参照及独立购入候选。
研究结果
分层得到 60 个高置信与 19 个中置信候选;二次检测 15/79 个未达到该次复现标准。

适用条件与研究局限

  • 一个正常参照细胞系反映特定细胞背景,人体整体治疗窗需其他证据。
  • 主文高置信对照 Z 分数阈值与所列药物例子不一致,使用完整流程时需核对数据和补充。
  • 不同预筛/主筛药库以及复测浓度与判断标准分别记录。

来源与原文

  1. High-throughput drug screening identifies novel therapeutics for Low Grade Serous Ovarian Carcinoma原始研究 · Scientific Data · 2024-09-19

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