NAMs新方法学前沿

C9ORF72 患者神经元模型的 ASO 细胞保护评价

比较不同靶向位置的 ASO 对 RNA 聚集、蛋白定位、基因表达和细胞损伤的影响。

用途与模型

研究用途
评估反义干预能否减轻重复 RNA 相关患者细胞表型。
模型与细胞来源
患者成纤维细胞重编程所得的人诱导多能干细胞(iPSC)分化为混合神经元,其中约 30%–40% 表达 HB9。
方法版本
2013 年患者混合神经元、RNA 聚集及谷氨酸损伤版本
实验形式
RNA FISH、免疫染色、Nanostring 及活/死荧光检测。

材料与平台

反义候选
靶向重复序列、下游内含子或外显子 2 的反义寡核苷酸(ASO);从超过 250 个候选中选取若干比较。
处理顺序
细胞先接受 ASO 处理 72 小时,再暴露于 30 μM 谷氨酸 4 小时开展损伤比较。
损伤测量
不同谷氨酸条件范围 1–100 μM、2–8 小时;碘化丙啶与 calcein-AM 各 1 μM 量化活/死细胞。
分子指标
检测 RNA 聚集与 ADARB2 定位;用 Nanostring 量化 C9ORF72 V1/V2 转录本和候选基因;抗体主要检测 poly(Gly-Pro) 二肽重复蛋白。

测量指标与分析

  • RNA 聚集阳性比例
  • C9ORF72 转录本
  • ADARB2 核内定位
  • 候选基因表达
  • 谷氨酸损伤
  • poly(Gly-Pro) 信号

比较靶向重复序列及下游位置的候选,分别分析 C9ORF72 V1/V2 水平、RNA 聚集、基因表达与细胞损伤。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
患者及健康细胞、不同 ASO 靶向位置与非靶向 ASO;功能检测加入谷氨酸。
测试范围
RNA 聚集分析采用 4 个患者神经元细胞系,ASO 比较采用 3 个患者细胞系。
参照体系
健康对照、患者非靶向 ASO、重复靶向及下游靶向候选。
研究结果
ASO 减少 RNA 聚集并改善部分异常表达和谷氨酸损伤;重复序列靶向候选保留所测 V1/V2 水平,poly(Gly-Pro) 信号仍可检测。

适用条件与研究局限

  • 不同实验使用不同患者细胞系;培养物不是纯运动神经元。
  • 论文正文记载谷氨酸暴露 4 小时,图 7E 图注写 5 小时。
  • 蛋白抗体主要检测 poly(Gly-Pro),其他二肽重复蛋白产物的变化未分别测量。

来源与原文

  1. RNA Toxicity from the ALS/FTD C9ORF72 Expansion Is Mitigated by Antisense Intervention原始研究 · Neuron · 2013-10-16

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