NAMs新方法学前沿

Tox21 对象的 ADME 预测与体外实验对照

将分子图模型预测与稳定性、溶解度及被动通透性测量比较,辅助药物与毒理候选排序。

用途与模型

研究用途
药物暴露相关筛查信息及计算模型在新化合物资料中的适用性评价。
模型与细胞来源
ADME@NCATS 基于实验资料训练的分子图预测模型。
方法版本
2026 原研究;基础 ADME 与 PAMPA-BBB 分层
实验形式
180 种基础 ADME 对象与 55 种 PAMPA-BBB 对象分开,与真实体外实验比较。

材料与平台

基础评价对象
180 种 Tox21 化合物;80 种已有资料从训练中移出,100 种补做实验。
脑相关被动通透对象
55 种可获得化合物,非随机人群或完整神经毒性验证集。

测量指标与分析

  • 大鼠肝微粒体稳定性
  • 水相溶解度
  • PAMPA-GIT 及 PAMPA-BBB 被动通透性
  • AUC、平衡准确率及分类错误

不同实验终点与相应预测逐项比较,按结构相似性观察适用范围;主动转运和完整体内暴露分开。

研究设计与结果

药物集评价

研究设计
训练去重后在选定 Tox21 对象上比较预测与实验。
测试范围
基础评价 180 种、PAMPA-BBB 为 55 种;个别终点有缺测,按实际有效数据报告。
参照体系
各相应体外 ADME 测量。
研究结果
大鼠肝微粒体稳定性、PAMPA-GIT 通透性和水相溶解度的 AUC 分别为 0.87、0.92 和 0.81;PAMPA-BBB 约为 0.77。不同终点的敏感度与适用范围不同。

适用条件与研究局限

  • 库存选择与缺测影响代表性。
  • PAMPA 不覆盖主动转运。
  • 大鼠微粒体不等同人全身处置,工具比较依赖各自终点条件。

来源与原文

  1. Integrating in silico ADME modeling with Tox21 toxicity profiling to support compound prioritization原始研究 · Scientific Reports · 2026-10-09

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