NAMs新方法学前沿

阿尔茨海默病状态与 APOE 基因型的脑类器官分组表型评价

按认知状态与 APOE 基因型分为 4 组,比较脑类器官的凋亡、突触、β 淀粉样蛋白(amyloid-β,Aβ)、磷酸化 tau 和应激颗粒,并作同基因背景复核。

用途与模型

研究用途
为神经疾病候选靶点和干预研究提供人源模型的表型评价;本研究未完成药物筛选性能验证。
模型与细胞来源
20 条人诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)系:认知正常与阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)来源各分 APOEε3/ε3 和ε4/ε4,4 组各 5 系。
方法版本
原论文已核对的体外评价版本
实验形式
在第 4/8/12 周检查病理,主要第 12 周比较;单独加入 1 条亲本系与同基因 APOE3 配对系验证。

材料与平台

模型
iPSC 来源含神经元与星形胶质细胞的脑类器官;2 批独立分化。
检测
表层 cleaved CASP3、synaptophysin/PSD95、Aβ40/42、p-tau、G3BP/EEA1/LAMP1;核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)测序。
分析
协方差分析纳入疾病/APOE 及交互,调整性别/取样年龄/细胞来源;配对系用 Mann–Whitney 检验。

测量指标与分析

  • 表层凋亡和裂解 caspase-3 比例
  • 突触蛋白
  • 可溶/不溶 Aβ及 Aβ42/40
  • 磷酸化 tau
  • 应激颗粒与转录特征

每项终点分别判断疾病状态、APOE 主效应和交互,不从某个终点推断全部病理变化。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
在第 4/8/12 周检查病理,主要第 12 周比较;单独加入 1 条亲本系与同基因 APOE3 配对系验证。
测试范围
4 组各 5 细胞系;Fig2 染色每系 5 类器官取平均,蛋白每系 4–5 类器官混合;同基因比较重复样本 n=6,不是患者数。
参照体系
认知正常/AD 与 APOE3/4 四组;第 4 周对第 12 周;单个亲本 APOE4 对同基因 APOE3。
研究结果
患者 APOE4 组凋亡较高;患者组突触蛋白低且可溶 Aβ 高,两者未见显著 APOE4 主效应;synaptophysin 有交互项;AT8 和酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)的 p-tau 与疾病及 APOE 各自相关,PHF1 无显著 APOE4 主效应;同基因 APOE3 减轻多项表型。

适用条件与研究局限

  • 12 周不溶 Aβ与斑块未检出。
  • 中心坏死、大小差异、缺血管免疫成分及性别未匹配限制比较。
  • 没有治疗药物实测;同基因验证只来自 1 亲本系。

来源与原文

  1. APOE4 exacerbates synapse loss and neurodegeneration in Alzheimer’s disease patient iPSC-derived cerebral organoids原始研究 · Nature Communications · 2020-11-02

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