实验前筛选与实验后组织评价
2025 年 8 月 11 日，Scientific Reports 发表一项皮层类器官质量控制研究。法国 SupBiotech 生物技术工程学院（SupBiotech, Ecole d’Ingénieurs en Biotechnologies）、法国原子能和替代能源委员会（Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives，CEA）等机构与 NETRI 公司合作，尝试通过可追踪的质量记录描述培养状态。
皮层类器官在同一批次内也可能出现形态、生长和细胞组成差异。作者将问题分成两个阶段：在实验开始前选择状态适宜的模型，以及在实验结束后评价组织发生了哪些变化。
框架依据团队过去 4 年的模型研究经验开发，涉及超过 30 个独立批次、超过 1,200 个类器官。
五类指标组成分层评分
作者设置形态、大小与生长、细胞组成、细胞组织结构和细胞毒性五类指标。每类指标包含具体观察项目，用于描述不同层面的质量。
每项观察按 0–5 分评价，评分同时设置单项最低要求和组合门槛。例如，密实程度、边界和囊腔 3 项形态指标的最低分合计为 8 分，但形态模块要求至少 9 分，因此模型至少要在其中一项超过最低标准。
阈值与模型的细胞来源、培养阶段和组成有关。本框架针对培养至第 60 天的皮层类器官，作者也提出后续需要按不同细胞系和条件调整。
实验前筛选采用非侵入性观察
初始质量评价主要使用外部形态和生长记录，让拟用于后续实验的组织保持完整。连续记录比某一天的一张外观照片包含更多信息：看起来相近的组织，可能具有不同的生长轨迹。
示例批次包含 58 个类器官，初始评价排除了其中 10 个，约占 17%。
氧化损伤后的细胞组成与 DNA 损伤染色
作者以氧化损伤处理构建不同状态的组织，比较 6 组、每组 4 个类器官，并在结束时增加内部细胞和损伤评价。这一比较检验的是评分框架是否能够识别状态变化。
观察包括 SOX2、TUBB3 和 GFAP 等标志，分别提供神经祖细胞、未成熟神经元及星形胶质细胞相关信息。
部分组织外观仍较完整，但内部细胞密度下降或 GFAP 阳性区域增加。γH2AX 染色进一步用于评价 DNA 损伤。
不同程度的损伤在不同环节被识别：严重破碎的组织首先未通过形态评价；另一些组织因 GFAP 阳性区域增加，或细胞密度降低而被排除。最高损伤组的总分中位数为 5/50，未处理对照为 47/50，显示分层评分能够区分这一实验中的质量差异。
无法测量和实际异常分开处理
部分受损组织无法完成包埋和切片，因而被排除在后续免疫染色评价之外。作者将这类失败记录在质量表格中。
在这次结束评价中，作者没有重新评估短期生长，因为 1 周间隔不足以观察有意义的生长变化。神经玫瑰花结相关项目也没有用于本批评分，因为对照组织没有呈现适合该项目的结构。
质量记录与神经功能评价方向
作者还提出，可根据同一批次及不同批次的分数分布，回顾模型的一致性。形态和免疫染色图像未来可纳入自动分析；培养液中的损伤或代谢指标也可能减少破坏性检测，但三维组织难以准确计数细胞，仍需解决这些检测的归一化问题。
作者提出，后续可结合钙成像、膜片钳或微电极阵列记录，评价神经网络活动，并根据研究用途选择适合的功能指标。
作者在利益声明中说明，部分作者受雇于 NETRI 公司，其中包括公司的首席执行官与联合创始人。