predicTox 心脏毒性通路与遗传变异候选分析
把药物心脏风险、iPSC 心肌细胞转录变化和供者变异关联，用于机制候选筛选。
用途与模型
- 研究用途
- 心脏毒性机制及供者差异的研究假设形成。
- 模型与细胞来源
- 6 名健康供者 iPSC 衍生心肌细胞的既有转录组和基因组资料；TKI 与蒽环类药物。
- 方法版本
- 2026 年数据库整合与候选排序版本
- 实验形式
- 差异表达、药物相关子空间、通路排序、反应异常细胞与变异关联。
材料与平台
- 细胞与药物数据
- 此前发表的数据重新整合；本次数据库论文没有新增独立临床验证队列。
- 风险与基因信息
- FAERS 报告比值比、文献临床风险、MBCO 通路及药物相关基因资料。
测量指标与分析
- 差异表达基因
- 通路排序
- 供者反应差异
- 候选变异
基因排序与通路频率联合评分，偏重精确度；通路评分曲线面积用于候选排序。
研究设计与结果
方法可行性研究
- 研究设计
- 结合既有实验资料与临床风险信息，展示药物卡片及机制/变异用例。
- 测试范围
- 6 名健康供者；蒽环类分析 128 个候选变异。
- 参照体系
- 不同药物心脏风险背景、细胞系反应及已有变异关联报道。
- 研究结果
- 数据库提供候选通路与变异查阅，包含已报道 RARG rs2229774；候选仍需功能验证。
适用条件与研究局限
- 不良事件报告信号与临床发生率分别记录。
- 曲线面积为通路排序用途，未给出独立临床预测性能。
- 主要为心肌细胞和有限供者资料。
- 原始细胞与算法资料来自前期研究，数据库论文未新增独立验证队列。
来源与原文
- predicTox: an integrated database of clinical risk frequencies and human gene expression signatures for cardiotoxic drugs原始研究 · Database: The Journal of Biological Databases and Curation · 2026-02-02