NAMs新方法学前沿

转移性结直肠癌类器官的治疗史与 5 天药敏比较

比较 35 个转移性结直肠癌患者来源类器官(PDO)的生长校正化疗反应,并结合既往治疗、全基因组和表达信息分析模型间差异。

用途与模型

研究用途
研究治疗背景与肿瘤模型药物反应、基因组及转录特征之间的关系。
模型与细胞来源
微卫星稳定转移性结直肠癌活检来源 35 个 PDO;17 个首线姑息治疗前、18 个既往治疗后模型。培养使用基底膜提取物,缺少完整免疫和基质环境。
方法版本
2025 年 35 个转移性结直肠癌 PDO 的 5 天生长校正药敏研究
实验形式
384 孔板培养,检测体系含 10% 基底膜提取物。8 点对数药物梯度处理 5 天,分别在处理起点及终点测 CellTiter-Glo 3D 信号。

材料与平台

模型
转移灶来源结直肠癌 PDO;治疗分组不等同同患者完整前后配对。
受试化疗药
5-氟尿嘧啶、SN-38 和奥沙利铂;SN-38 为伊立替康活性代谢物。
比较资料
处理起点/第 5 天 ATP 信号,载体参照;全基因组与 RNA 测序、临床治疗记录。

测量指标与分析

  • 生长速率校正剂量反应及 GRAUC
  • 结构变异和化疗相关突变特征
  • 脆性位点缺失与单药反应关联
  • 临床奥沙利铂分组及表达差异

使用起点和终点 ATP 信号作生长校正,以未拟合曲线计算生长速率校正曲线下面积(GRAUC),并按各药物范围归一化;GRAUC 较高对应较弱抑制。临床奥沙利铂比较为既往治疗组内 9 个低反应与 9 个仍有反应病例。

研究设计与结果

实验条件比较;临床关联研究

研究设计
按转移性疾病治疗史及基因组特征比较单药反应。
测试范围
35 个 PDO,17 个首线姑息治疗前及 18 个既往治疗后;临床独立测序集合 78/138 份肿瘤材料。
参照体系
各模型起点/终点及载体参照;两治疗史组、缺失或突变特征分组。
研究结果
两治疗史组平均单药反应总体相近;在既往治疗组内,脆性位点缺失与 SN-38 GRAUC 较高有关,另两药差异未显著。

适用条件与研究局限

  • 队列人群及临床经过不同,非全体纵向配对。
  • 方法正文对同一药筛的技术重复先后记为 3 次与 2 次,存在描述差别。
  • 生长校正反应针对本研究所测药物梯度和 5 天窗口。

实验条件比较;临床关联研究

研究设计
比较既往治疗组内临床奥沙利铂反应与 PDO 单药反应及表达。
测试范围
18 个既往治疗模型,临床奥沙利铂两组各 9 例。
参照体系
临床奥沙利铂低反应与仍有反应者的 PDO。
研究结果
低反应组的奥沙利铂/5FU GRAUC 较高,SN-38 未显著;Hedgehog 相关表达富集。

适用条件与研究局限

  • 所有既往治疗病例临床 5FU 低反应,只有部分 PDO 保留这一表现。
  • 表达及测序关联尚无逐项机制干预,未完成前瞻性选药验证。

来源与原文

  1. Impact of treatment history on drug resistance of metastatic colorectal cancer organoids原始研究 · iScience · 2025-10-17

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