NAMs新方法学前沿

CYP 可逆与时间依赖性抑制的 QSAR 预测

由分子结构预测 CYP 抑制,分别分析 4 种酶的可逆抑制和 CYP3A4 的时间依赖性抑制。

用途与模型

研究用途
筛查药物及其代谢物的酶抑制潜力,为药物相互作用研究提供线索。
模型与细胞来源
来源于公开实验与药物资料的分子结构—抑制分类数据。
方法版本
2025 年论文中的 5 个 CYP 抑制模型,Leadscope Enterprise 3.9
实验形式
二分类 QSAR、结构警示与外部验证

材料与平台

训练资料
10,129 种独立化学物的 CYP 抑制资料,覆盖药物与其他化学物。
建模工具
Leadscope Enterprise 3.9、分子结构特征及整理后的实验抑制标签。

测量指标与分析

  • 酶抑制分类
  • 灵敏度与特异性
  • 阴性预测值
  • 预测覆盖率
  • 适用域

分别建立 CYP3A4、2C9、2C19、2D6 可逆抑制模型及 CYP3A4 时间依赖性抑制模型;结构警示辅助处理部分不确定预测。 概率高于 0.6 判为阳性、低于 0.4 判为阴性,中间范围为不确定;适用域单独判断。

研究设计与结果

训练集与交叉验证

研究设计
训练集中进行重复留出交叉验证,并使用以药物为主的独立外部资料评价。
测试范围
5 个模型,训练资料合计 10,129 种化学物;各酶模型和外部测试集的数量分别登记于原文表格。
参照体系
实验测得的可逆或时间依赖性 CYP 抑制标签。
研究结果
交叉验证灵敏度为 78%–84%;外部验证的表现随酶类型和抑制机制变化。

适用条件与研究局限

  • 适用域外与不确定预测不纳入部分性能统计,外部药物集的化学空间与训练集有差别。

来源与原文

  1. Novel (Q)SAR models for prediction of reversible and time-dependent inhibition of cytochrome P450 enzymes原始研究 · Frontiers in Pharmacology · 2025-02-12

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