NAMs新方法学前沿

4 区室脑 PBPK 模型的物理约束参数反演

把仿真浓度、初始条件和物质平衡方程共同用于逆向物理信息神经网络(iPINN)训练,估计 4 区室脑生理药代动力学(PBPK)模型的 6 个参数。

用途与模型

研究用途
脑部药物暴露模型的仿真校准与逆向参数估计可行性分析。
模型与细胞来源
Simcyp 生成 100 名虚拟健康志愿者单次口服 10 mg 阿贝西利后的血浆与 4 脑区室平均浓度;48 小时内 200 个时间点。
方法版本
2025 年原研究版本
实验形式
时间输入、4 个区室的浓度输出;脑血液/脑组织/颅内脑脊液/脊髓周围脑脊液 4 区室常微分方程,血浆浓度为外源输入。

材料与平台

待估参数
4 区室容积、脑血液游离药物比例和颅内脑脊液非离子化药物比例。S 形函数(Sigmoid)变换把参数映射至预设生理边界。
损失与网络
数据、方程残差、初始状态损失;进一步反演时权重分别为 3、2、1。6 层、每层 50 个神经元、双曲正切激活,DeepXDE 及 PyTorch 自动微分。
优化与比较
Adam 学习率 0.0001,5,000,000 次迭代后继续有限内存拟牛顿优化。以相同参数边界与随机近似期望最大化、差分进化的参数估计及各自数值求解结果比较。

测量指标与分析

  • 浓度拟合误差
  • 方程残差和初始条件损失
  • 参数绝对误差
  • 区室浓度—时间曲线
  • 优化迭代与运行时间

在同一仿真平均曲线上联合优化神经网络与 6 个物理参数,再以估计参数正向求解并对照已知仿真参照。未设置独立临床或新药物测试集。

研究设计与结果

方法可行性研究

研究设计
先比较网络超参数,随后在已知仿真资料上估计 6 个参数并重建浓度曲线。
测试范围
100 名虚拟志愿者的汇总平均数据、200 个时间点。
参照体系
已知仿真参数与浓度参照;同边界条件的另外 2 类参数估计算法。
研究结果
6 个参数反演的总损失约为 1.23 × 10⁻⁵;4 个区室容积的误差约为 9 × 10⁻⁹ 至 9 × 10⁻⁸,另外 2 个比例参数的绝对误差约为 0.0037 和 0.0047。

适用条件与研究局限

  • 数据由同类 PBPK 模型生成,属于模拟参数恢复,尚未独立临床验证。
  • 不同参数/算法的误差不同,未建立跨药物统一优先级。
  • 训练损失随迭代仍可改善;这次 5,000,000 次迭代运行约 54,977 秒,结果限于该模拟案例和训练设置。
  • 采用 arXiv v1 预印本,尚未经过同行评审。

来源与原文

  1. PBPK-iPINNs : Inverse Physics-Informed Neural Networks for Physiologically Based Pharmacokinetic Brain Models原始研究 · arXiv · 2025-09-16

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