融合阳性小圆细胞肉瘤三维模型的药物筛选
以融合背景区分肉瘤模型，结合 ATP 活性浓度反应和凋亡成像，寻找亚型相关药物敏感性。
用途与模型
- 研究用途
- 儿童小圆细胞肉瘤的药物敏感性比较和靶向候选药物研究。
- 模型与细胞来源
- 直接患者材料或患者肿瘤 PDX 来源的三维肉瘤模型；不同疾病时期和融合亚型分别记录。
- 方法版本
- 2025 年 21 个模型的初筛与 MCL-1 复核
- 实验形式
- 悬浮三维培养及 384 孔药物筛选；选定模型以更多浓度进行复核。
材料与平台
- SCM 培养体系与肉瘤模型
- 3 类含 EGF、FGF2、IGF1 的 SCM 培养体系，包含 BME；不同融合亚型培养。
- 药物检测与成像
- CellTiter-Glo 3D、Spectramax i3x；Annexin V/PI 凋亡成像，GraphPad Prism v10.02。
测量指标与分析
- 相对 ATP 活性
- 浓度反应 AUC 与 IC50
- Annexin V/PI 凋亡
初筛设置 6 个浓度，以 120 小时终点与 T0 测量比较；复核使用 12 个浓度，载体对照归一为 100%。
研究设计与结果
实验条件比较
- 研究设计
- 186 种药物初筛；选取 MCL-1 等候选物作复核及凋亡分析。
- 测试范围
- 初筛 21 个模型来自 14 位患者；MCL-1 复核为 6 个 ES 和 6 个 CIC::DUX4 模型，技术重复和独立重复分开。
- 参照体系
- 不同融合背景、载体与阳性对照；相同模型初筛和复核。
- 研究结果
- CIC::DUX4 模型对 S63845 和 MIK665 的 IC50 为 0.9–39 nM；ES 仅 2 个模型可拟合到 IC50，其余未达到完整抑制平台。凋亡成像进一步支持该亚型反应。
适用条件与研究局限
- 初筛的 21 个模型来自 14 位患者，包含不同疾病时间点。
- 186 为方法段登记的初筛库，不用摘要中约数相加替代。
- 候选复核使用原模型子集，未提供独立患者前瞻治疗验证。
来源与原文
- Small round cell sarcoma tumoroid biobank reveals CIC::DUX4 sarcoma vulnerability to MCL-1 inhibition原始研究 · Nature Communications · 2025-08-21