NAMs新方法学前沿

肉瘤微环类器官 ATP 药物筛选

以微环三维培养和 ATP 活性快速比较单药/组合,药物选择按样本信息调整,并记录少量临床配对。

用途与模型

研究用途
软组织/骨肉瘤的个体化候选治疗筛选及不同样本的相对药物敏感性比较。
模型与细胞来源
收集 126 位患者 194 份标本;实际药筛子集与收集总数分别登记,含多部位/多时间样本。
方法版本
2024 年快速制备与样本定制药物 panel 版本
实验形式
96 孔 Mammocult/Matrigel 微环,成模 3 天、药物暴露 2 天;每 24 小时成像。

材料与平台

微环三维培养
新鲜肿瘤样本及 Mammocult/Matrigel;病理和分子资料核对肿瘤身份。
ATP 与成像检测
CellTiter-Glo、SpectraMax iD3,Celigo 明场成像;药物后组织从基质释放测 ATP。
定制药物库与质量对照
每样本平均 117 项药物/组合,范围 6–423;DMSO 阴性、星形孢菌素阳性;以 Z′/robust Z′ 筛选孔板。

测量指标与分析

  • ATP 活性
  • 标准化存活率
  • 相对药物敏感性排名
  • Z′/robust Z′
  • 模型生长面积
  • 临床下一次治疗时间

各孔按溶剂对照标准化,再相对同药物受测样本均值计算活性分数与排名;每药主要 1 或 2 个孔,临床配对另作小样本分析。

研究设计与结果

盲法比较研究

研究设计
不同肉瘤样本定制单药/组合;病理、分子一致性及临床配对分别评价。
测试范围
主要反应汇总为 92 份检测至少 10 项药物的标本;临床术后相同方案关联 5 人。
参照体系
同药物的其他样本、各孔板阳性/阴性对照及相应患者治疗资料。
研究结果
92 份中 74 份至少一项在本测试集敏感性前 5%;5 位患者的配对模型存活率与下一次治疗时间相关(R²=0.921,P=0.009)。

适用条件与研究局限

  • 各标本药物 panel 大小和构成不同,命中比例依赖测试集。
  • 药筛每条件重复有限;临床配对人数少。
  • 研究未按增殖速率标准化,临床比较缺少统一 RECIST 目标病灶评价。

来源与原文

  1. The landscape of drug sensitivity and resistance in sarcoma原始研究 · Cell stem cell · 2024-09-20

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