NAMs新方法学前沿

肿瘤与正常结直肠类器官的抗体高内涵筛选

将结直肠癌与正常黏膜类器官纳入抗体筛选,以多参数形态变化比较活性及组织选择性。

用途与模型

研究用途
双特异性抗体发现、候选复测及正常组织选择性比较。
模型与细胞来源
原发和肝转移结直肠癌 PDO,以及邻近正常黏膜类器官;各模型的生长因子依赖分别保留。
方法版本
2022 年 WNT×RTK 双抗和多参数形态评分版本
实验形式
BME2 中的 384 孔三维培养、7–9 天筛选、高内涵 Z 堆栈成像及多参数形态评分。

材料与平台

模型与基质
肿瘤/正常结直肠 PDO、Cultrex BME2、EGF/HRG 或 WNT 条件。
抗体与参照
WNT×EGFR/HER3 抗体库、MCLA-158、西妥昔单抗及不结合靶点的 TT 对照。
成像和分析
ImageXpress、Ominer/KNIME、Spotfire;细胞核、腔体及类器官形态特征。

测量指标与分析

  • 多参数形态响应
  • 类器官生长抑制
  • IC50
  • Z′ 因子
  • 正常/肿瘤选择性

检查分割、边缘效应和重复孔,500 个候选形态特征中选择 3–20 个区分参照条件,按欧氏距离归一化评分。

研究设计与结果

药物集评价

研究设计
3 个初筛 PDO 测超过 500 种双抗;28 种候选在扩展模型和正常黏膜中复测。
测试范围
样本库含 61 个原发和 11 个肝转移 PDO,来自 68 位患者;31 位有正常黏膜模型。二筛为 22 个肿瘤及 1 个正常模型,初/二筛各用重复孔。
参照体系
生长因子与撤除条件、TT 抗体、单臂/单抗参照和正常黏膜 PDO。
研究结果
初筛 Z′ 为 0.33±0.22(n=8);MCLA-158 抑制 52% 的所测 CRC 模型生长,部分 KRAS 变异模型也有响应。后续比较显示肿瘤与正常黏膜的作用不同。

适用条件与研究局限

  • 培养成功率 72.7% 是建库指标;形态评分和模型响应比例分别属于筛选结果。
  • 原主文与方法对初筛抗体浓度记载不同,具体复现需按原批次确认。
  • 正常模型和肿瘤库覆盖不同;此研究未开展前瞻性患者疗效预测。

来源与原文

  1. Functional patient-derived organoid screenings identify MCLA-158 as a therapeutic EGFR × LGR5 bispecific antibody with efficacy in epithelial tumors原始研究 · Nature Cancer · 2022-04-25

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