NAMs新方法学前沿

灌流脑类器官的连续形态质控与分类

灌流培养结合连续明场成像,以形态时间序列识别生长正常和异常的脑类器官。

用途与模型

研究用途
模型培养阶段的过程监测、批次筛选与成像数据分析。
模型与细胞来源
C1-2 人 iPSC 来源的前脑类器官,第 14 天起进入灌流装置;本版本主要使用单个细胞系。
方法版本
2024 年中尺度 CSTR 培养/连续明场版本
实验形式
8 腔并联中尺度连续搅拌釜式反应器(CSTR)设计,通过对流换液;定期明场记录单个类器官。

材料与平台

PDMS 灌流培养装置与泵
培养腔共享流路,泵和气泡捕集器支持连续培养;细胞来源与装置版本固定。
明场显微图像与形态时间序列
大小、圆度、长宽比及实心度等指标在连续时间点追踪。
图像处理与支持向量机
由 35 个特征中选择 12 个,比较线性与径向基核;组织学用于核对分类对应的结构差别。

测量指标与分析

  • 大小与生长速率
  • 外形及其时间变化
  • 正常/异常分类
  • SOX2、MAP2、CTIP2 组织表征

图像样本随机分为训练和测试资料,重复划分评估分类;独立类器官和外部批次的泛化能力需按各自单位核验。

研究设计与结果

训练集与交叉验证

研究设计
连续形态特征的模型分类,并考察装置内位置和装置之间的所测形态变异。
测试范围
分类资料为 70 张图像;70%/30% 训练/测试划分并重复 1,000 次,参数调节采用 5 折交叉验证。图像数与独立类器官数分开。
参照体系
人工形态分类、终末组织学,以及不同装置/腔体的形态资料。
研究结果
研究内形态分类准确率约 0.9;所测模型持续生长,各腔体位置未显示与末期直径的显著相关。

适用条件与研究局限

  • 分类性能来自研究内图像划分,独立供者和外部实验室验证尚需补充。
  • 主要细胞背景为 C1-2,药物处理未作为本研究的测试任务。
  • 形态变异和营养供给分析的结论适用于本培养与测量条件。

来源与原文

  1. Non-Invasive Quality Control of Organoid Cultures Using Mesofluidic CSTR Bioreactors and High-Content Imaging原始研究 · Advanced materials technologies · 2024-08-31

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