黑色素瘤三维组织培养的 T 细胞刺激与转录评价
用保留原组织免疫组分的黑色素瘤转移灶培养物，比较 CD3/CD28 刺激加纳武利尤单抗后的 T 细胞克隆、转录变化和已知临床治疗分组。
用途与模型
- 研究用途
- 研究组织内 T 细胞的刺激反应及免疫治疗相关生物标志物。
- 模型与细胞来源
- 31 名患者的手术转移灶用于半固体或空气—液体界面（ALI）三维培养；22 份至少一种培养成功。主要刺激比较为 4 个临床获益模型与 4 个免疫治疗后复发模型。
- 方法版本
- 2025 年 8 个黑色素瘤组织模型的 1 周共同 T 细胞刺激研究
- 实验形式
- 10 µg/mL 纳武利尤单抗与各 2 µg/mL anti-CD3（HIT3a）、anti-CD28（CD28.2）共同处理 1 周，比较刺激前与刺激后 RNA 数据；以组织培养内已有的免疫细胞为分析对象。
材料与平台
- 组织培养材料
- 手术黑色素瘤转移灶，含淋巴结、皮肤/皮下和中枢神经系统取材；两种培养形式保留免疫组分的程度与患者不同。
- 共同刺激条件
- 纳武利尤单抗、CD3 和 CD28 激动抗体共同刺激组织内已有的 T 细胞。
- 分析工具
- RNA 测序、MiXCR/VDJtools 克隆分析、MCP-counter 细胞特征推断；2 个病例另有 CosMx 空间转录分析。
测量指标与分析
- 刺激前后的 T 细胞受体克隆分布
- T 细胞活化与抗原呈递相关转录特征
- 组织培养免疫细胞组成和肿瘤身份
- 衍生 14 基因特征与外部治疗/生存数据的关联
比较模型治疗前后转录及克隆变化，按既有临床获益/复发材料分组；外部单细胞数据筛选 T 细胞基因，独立配对活检及混合临床队列分析评分关联。
研究设计与结果
临床关联研究
- 研究设计
- 在 8 个模型中比较共同刺激反应与已知临床分组，并在独立数据中探索衍生 14 基因特征。
- 测试范围
- 4 个获益模型与 4 个复发模型；外部治疗前后配对数据 42 人，生存数据 458 人，含不同治疗背景。
- 参照体系
- 同一培养物刺激前后、两种已知临床分组；外部高低基因评分组。
- 研究结果
- 获益组多数模型出现 T 细胞克隆扩增及活化基因上调；衍生基因评分在外部数据中与治疗中变化及生存相关。
适用条件与研究局限
- 刺激条件为 CD3/CD28 激动抗体加 PD-1 抗体。
- 5 个半固体培养物缺少黑色素瘤遗传改变和 SOX10 细胞信号。
- 空间比较为 2 例患者；外部生存队列包含 349 名主要未经免疫检查点治疗患者。
- 尚无依据模型结果前瞻指导患者用药的独立验证。
来源与原文
- Modeling anti-tumor immune responses using patient-derived melanoma organoids原始研究 · Cancer Immunology, Immunotherapy · 2025-12-23