乳腺癌空间蛋白组与配对三维肿瘤药筛
用固定组织中不同区域的蛋白表达选择候选药物，再在同一患者来源的三维肿瘤模型中比较反应。
用途与模型
- 研究用途
- 组织异质性相关的候选药物选择与体外功能比较。
- 模型与细胞来源
- 3 位未经治疗的早期管腔型乳腺癌患者，固定组织与新鲜组织培养模型配对。
- 方法版本
- 2026 年 3 位患者空间蛋白组及 7 天药筛版本
- 实验形式
- 8 μm 固定组织切片作质谱成像；三维培养模型在 96 孔板加药 7 天。
材料与平台
- 空间分析
- Bruker rapifleX MALDI-TOF；质谱成像与分区微蛋白组分析。
- 培养与存活
- Matrigel 三维培养；琼脂糖包被 96 孔板，CellTiter-Glo 3D。
- 药物比较
- 常规化疗药与组织蛋白组提示的候选组合；各组成药物亦分别测试。
测量指标与分析
- 蛋白表达分区与通路富集
- 模型与组织的蛋白组对应
- 7 天存活曲线与 IC50
- 其他患者模型中的组合反应
按切片质谱信号聚类并结合病理选择蛋白分析区域。药物存活信号相对对照归一化，拟合单药及组合曲线，并在另外 2 位患者的模型中比较。
研究设计与结果
方法可行性研究
- 研究设计
- 组织蛋白组选择候选药物，配对模型检测，再作跨模型比较。
- 测试范围
- 3 位患者各有 1 个匹配模型；药物条件设置 3 个平行孔。
- 参照体系
- 同模型单药与组合、常规化疗与候选药物、不同患者模型。
- 研究结果
- cerulenin 与舒尼替尼联用时，其他患者模型的 IC50 为原配对模型的 5 倍以上；另 2 种组合在模型间的 IC50 比值约为 1.3–2。
适用条件与研究局限
- 蛋白表达分区没有分别作遗传克隆验证；三维药筛在每位患者的整体培养模型开展。
- 未开展正式药物协同分析；不同模型的组合增益不同。
- 仅 3 位患者，尚无该流程指导治疗的临床获益结果。
- cerulenin 为研究试剂，舒尼替尼有效体外浓度高于文中引用的患者血浆浓度。
来源与原文
- Clone-By-Clone Therapy Guidance in Luminal Breast Cancer Via Spatial Proteomics and Patient-Derived Tumoroid原始研究 · Molecular & Cellular Proteomics · 2026-08-12