结直肠癌原发灶与肝转移类器官的多组学药物分析
整合配对模型的 RNA、胞外囊泡 miRNA 与药物曲线 AUC，探索原发与转移模型的差异和候选靶点。
用途与模型
- 研究用途
- 配对结直肠癌模型的分子—药物反应关联及肝转移相关分类探索。
- 模型与细胞来源
- 5 位患者的 11 个模型；4 例由早期传代细胞系建立，1 例直接由患者组织建立，保留来源区别。
- 方法版本
- 2025 年 5 位患者配对模型与 DIABLO 版本
- 实验形式
- BME 三维培养、96 孔药物曲线；RNA 测序、miRNA 微阵列与 DIABLO/自动机器学习整合。
材料与平台
- 配对模型与培养基质
- BME 与 HISC 培养条件；原发灶和同步肝转移模型。
- 21 个药物的反应资料
- 6 点、1:3 浓度梯度，给药前培养 72 小时；技术重复的药物曲线 AUC。
- 多组学分析
- mixOmics 6.22.0 DIABLO，319 个 RNA 特征、296 个 miRNA 特征及 21 个药物反应；lares 分类探索。
测量指标与分析
- 药物曲线 AUC
- RNA 表达
- 胞外囊泡 miRNA 表达
- 原发/转移分类特征
- 通路与药物反应关联
药物 AUC 与筛选后的表达矩阵按模型对应，原发/肝转移作为 DIABLO 分类标签；进一步探索通路与药物反应的联合变量。
研究设计与结果
盲法比较研究
- 研究设计
- 同患者原发/肝转移模型内比较及多组学特征筛选；机器学习在本队列划分训练与测试。
- 测试范围
- 5 位患者、11 个模型；药筛至少 3 次，最终 AUC 为技术重复均值。
- 参照体系
- 对应患者原发灶模型与肝转移模型；模型内药物和分子变量。
- 研究结果
- 发现可区分两类模型的多组学特征，以及 KRAS 通路分数/瑞戈非尼反应等关联变量；作者提出候选靶点。
适用条件与研究局限
- 仅 5 位患者，分类与关联尚需独立队列验证。
- 4 例模型通过早期传代细胞系建立。
- 所读主文未完整给出药筛终点检测和给药后暴露时长；条目按已有 AUC 输入与数据整合整理。
来源与原文
- Integrative multi-omics of matched primary and liver metastatic colorectal cancer organoids identifies putative molecular targets原始研究 · Translational Oncology · 2025-11-04