NAMs新方法学前沿

心肌微组织 APD 的 Logistic 曲线拟合与分层变异分析

结合动作电位模拟、微组织浓度响应和分层基线变异,用 Logistic 曲线拟合估计动作电位持续时间(APD)延长 5% 的效应起始点(POD),并计算不确定范围。

用途与模型

研究用途
选择心脏安全性试验的浓度数、分化批次和微组织数量,并估计复极相关药物效应起始浓度。
模型与细胞来源
人心室动作电位计算模型;WTC11 诱导多能干细胞衍生心肌细胞与 5% 人原代心脏成纤维细胞组成的三维工程微组织。
方法版本
2025 年 4 参照药、5% APD 阈值与 90% 区间版本
实验形式
35 小孔/琼脂糖模具,微组织培养 6–8 天并施加 1 Hz 电刺激;药物数据为基线后 6 个逐次递增浓度,覆盖 3 个数量级。

材料与平台

药物数据
既有西沙必利、雷诺嗪、奎尼丁、维拉帕米动作电位数据;本研究增加基线重复记录分析平台变异。
模拟与终点
ToRORd 人心室动作电位模型为主,改变 hERG 钾通道阻断与其他离子电流;模拟 APD90,实测以最大复极速率相关时点计算 APD。
曲线与重抽样
Logistic 曲线拟合、2 段线性和最大曲率比较;保留单个微组织完整浓度曲线的自助重抽样 5,000 次,以第 5 和第 95 百分位计算 90% 区间。

测量指标与分析

  • APD 相对基线变化
  • APD 延长 5% 的 POD
  • POD 的 90% 置信区间
  • 批次、模具、微组织和搏动层级变异
  • 假阳性与检出率

优先拟合早期后除极出现前的浓度段;从实际平台分层变异进行蒙特卡洛样本设计,结合 5% 变化阈值评价统计检验结果。

研究设计与结果

实验条件比较

研究设计
比较 3 类曲线估计和浓度点数,再以平台变异模拟不同批次、模具和微组织数量,并应用到既有 4 药数据。
测试范围
基线为 14 个独立心肌分化批次、57 个模具、1,701 个微组织;4 药数据各来自 2–3 个独立分化批次、3 个模具。
参照体系
最大曲率、2 段线性、Logistic 曲线拟合;有无早期后除极的浓度段;整曲线与逐浓度汇总重抽样。
研究结果
Logistic 曲线拟合对异常高浓度段及采样减少较稳定,不少于 6 个浓度点时模拟误差较低。按整条微组织曲线重抽样通常得到较窄区间;加入 5% APD 变化阈值可减少重复测量检验的假阳性。

适用条件与研究局限

  • 实际终点和模拟终点的复极定义不同。
  • 样本设计建议依赖该平台测得的批次、模具和微组织变异。
  • 药物检验限于 4 种既有参照药,尚未覆盖完整综合体外致心律失常评价(CiPA)药物集。
  • 简单 hERG 药物结合模型未覆盖通道表达、加工改变等机制。

来源与原文

  1. Computationally informed point of departure evaluation for proarrhythmic cardiotoxicity assessment using 3D engineered cardiac microtissues from human iPSC-derived cardiomyocytes原始研究 · Toxicological Sciences · 2025-07-21

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